More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2057 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2057  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
268 aa  531  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28022  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2290  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  96.27 
 
 
268 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142141  normal  0.98078 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1589  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  69.03 
 
 
267 aa  378  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2065  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  63.43 
 
 
267 aa  352  5e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2236  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  63.95 
 
 
240 aa  299  4e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0953  amino acid ABC transporter, permease protein  63.09 
 
 
240 aa  295  4e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.578847  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1563  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  61.37 
 
 
237 aa  288  7e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.086799  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2322  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  52.16 
 
 
239 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.893058  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3594  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  52.16 
 
 
239 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2178  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  52.16 
 
 
239 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.142027  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2809  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.72 
 
 
239 aa  228  9e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.309944  normal  0.926456 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0597  amino acid ABC transporter, permease protein  44.74 
 
 
240 aa  187  2e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0884053  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1114  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.54 
 
 
229 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.384644  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6914  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.47 
 
 
241 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0299  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.42 
 
 
230 aa  168  7e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0837568  normal  0.0626241 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0304  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.42 
 
 
230 aa  168  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0016104  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0281  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  48.42 
 
 
230 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0627068  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4271  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.98 
 
 
231 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000112521 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4929  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.43 
 
 
231 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0205937  hitchhiker  0.0000000789331 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5921  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.16 
 
 
241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.610786  normal  0.165756 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0297  ABC basic amino acid transporter, inner membrane subunit  41.7 
 
 
244 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5892  ABC transporter permease  41.33 
 
 
231 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0328  amino acid ABC transporter permease  41.85 
 
 
244 aa  162  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2073  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.97 
 
 
246 aa  162  8.000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68080  ABC transporter permease  40.89 
 
 
231 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.382503  normal  0.0204508 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0310  amino acid ABC transporter permease  43.75 
 
 
231 aa  158  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000193986  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5359  amino acid ABC transporter, permease protein  43.75 
 
 
231 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4913  amino acid ABC transporter permease  42.86 
 
 
231 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0253  arginine transporter permease subunit ArtQ  38.86 
 
 
223 aa  154  2e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00505088  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4285  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.89 
 
 
225 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0276895  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2560  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.3 
 
 
230 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.645171  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4840  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.89 
 
 
225 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545995  normal  0.251621 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0592  arginine ABC transporter, permease protein  40.65 
 
 
221 aa  152  5e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0258675  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1593  arginine transport system permease protein  40.65 
 
 
221 aa  152  5e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.216044  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00867  arginine transporter subunit  40 
 
 
238 aa  151  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.202852  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2780  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 
238 aa  151  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00967955  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2469  arginine transporter permease subunit ArtQ  38.84 
 
 
238 aa  151  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.391563  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2627  arginine transporter permease subunit ArtQ  40.36 
 
 
238 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.204375  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1581  arginine transporter permease subunit ArtQ  40.36 
 
 
238 aa  151  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0935  arginine transporter permease subunit ArtQ  40 
 
 
238 aa  151  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2734  arginine transporter permease subunit ArtQ  40 
 
 
238 aa  151  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0586836  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00873  hypothetical protein  40 
 
 
238 aa  151  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.202246  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0966  arginine transporter permease subunit ArtQ  40 
 
 
238 aa  151  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2712  arginine transporter permease subunit ArtQ  40.36 
 
 
238 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0890  arginine transporter permease subunit ArtQ  40 
 
 
238 aa  151  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.125832  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3519  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.5 
 
 
240 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405389  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1022  arginine transporter permease subunit ArtQ  39.56 
 
 
238 aa  149  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.563398 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1378  arginine transporter permease subunit ArtQ  38.39 
 
 
238 aa  150  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0926  arginine transporter permease subunit ArtQ  37.95 
 
 
238 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.412131  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0961  arginine transporter permease subunit ArtQ  37.95 
 
 
238 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1024  arginine transporter permease subunit ArtQ  37.95 
 
 
238 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0993  arginine transporter permease subunit ArtQ  37.95 
 
 
238 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.908225  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1043  arginine transporter permease subunit ArtQ  37.95 
 
 
238 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.163661  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4137  amino acid ABC transporter, permease protein  37.27 
 
 
237 aa  149  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3875  amino acid ABC transporter permease  37 
 
 
242 aa  148  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.426238 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6801  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.44 
 
 
225 aa  148  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.793236  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2377  ABC His/Glu/Gln/Arg/opine transporter, inner membrane subunit  36.11 
 
 
243 aa  148  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.413222  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4287  ABC polar amino acid transporter, inner membrane subunit  34.72 
 
 
229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1654  arginine transporter permease subunit ArtQ  38.57 
 
 
246 aa  146  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.571683 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4835  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.17 
 
 
240 aa  145  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.716985  normal  0.137601 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2378  arginine transporter permease subunit ArtQ  42.7 
 
 
238 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.677527  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2567  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.19 
 
 
229 aa  145  9e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.386415  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1410  histidine ABC transporter, permease protein  36.11 
 
 
229 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157931  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0885  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.26 
 
 
229 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.524811 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2915  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.57 
 
 
229 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5101  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.04 
 
 
240 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0381438  decreased coverage  0.00220155 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4638  amino acid ABC transporter permease  35.19 
 
 
229 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5464  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.65 
 
 
229 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1926  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.2 
 
 
228 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1153  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.8 
 
 
229 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.176367 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3725  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.19 
 
 
229 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0898326 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1209  amino acid ABC transporter permease  39.46 
 
 
242 aa  143  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1094  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  33.8 
 
 
229 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.914927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1247  histidine transport system permease protein  33.8 
 
 
229 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1089  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  33.8 
 
 
229 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0696  amino acid ABC transporter permease  33.8 
 
 
229 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.156874  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1175  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.8 
 
 
229 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1828  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  34.32 
 
 
240 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300709  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3607  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.65 
 
 
229 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488418  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3017  histidine ABC transporter, permease protein  33.8 
 
 
229 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.606762  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1580  histidine ABC transporter, permease protein  33.8 
 
 
229 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0987  histidine ABC transporter, permease protein  33.8 
 
 
229 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689242  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1827  arginine/ornithine ABC transporter, permease protein  34.1 
 
 
229 aa  142  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.883387  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2129  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.26 
 
 
260 aa  142  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356557  normal  0.354244 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3774  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.48 
 
 
229 aa  141  9e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134573  hitchhiker  0.00153221 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3570  amino acid ABC transporter permease  33.64 
 
 
229 aa  141  9e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.906452  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2594  histidine ABC transporter permease HisQ  34.36 
 
 
228 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2582  histidine ABC transporter permease HisQ  34.36 
 
 
228 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.114361 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0889  amino acid ABC transporter, permease protein  33.8 
 
 
229 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2540  histidine ABC transporter permease protein HisQ  34.36 
 
 
228 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.512507  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2494  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  34.36 
 
 
228 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.174518  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2703  histidine ABC transporter permease HisQ  34.36 
 
 
228 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001574  arginine ABC transporter permease protein ArtQ  39.41 
 
 
229 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.552599  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7394  ABC transporter membrane spanning protein  34.08 
 
 
240 aa  141  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.330237  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02233  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  34.72 
 
 
228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1348  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.72 
 
 
228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.120013  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1959  arginine/ornithine periplasmic binding protein-dependent transporter, inner membrane component  35.04 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.450154  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1057  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.8 
 
 
229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1791  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.72 
 
 
229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.369418  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3448  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  34.72 
 
 
228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.869706  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>