More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001574 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05530  arginine transporter permease subunit ArtQ  99.56 
 
 
229 aa  449  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001574  arginine ABC transporter permease protein ArtQ  100 
 
 
229 aa  449  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.552599  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0699  arginine transporter permease subunit ArtQ  82.53 
 
 
229 aa  362  3e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.127181  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1654  arginine transporter permease subunit ArtQ  55.61 
 
 
246 aa  228  6e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.571683 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1022  arginine transporter permease subunit ArtQ  55.61 
 
 
238 aa  222  4e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.563398 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1581  arginine transporter permease subunit ArtQ  53.81 
 
 
238 aa  221  6e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2627  arginine transporter permease subunit ArtQ  53.81 
 
 
238 aa  221  6e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.204375  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2712  arginine transporter permease subunit ArtQ  53.81 
 
 
238 aa  221  6e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00867  arginine transporter subunit  55.61 
 
 
238 aa  221  7e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.202852  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2780  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.61 
 
 
238 aa  221  7e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00967955  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0935  arginine transporter permease subunit ArtQ  55.61 
 
 
238 aa  221  7e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2734  arginine transporter permease subunit ArtQ  55.61 
 
 
238 aa  221  7e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0586836  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0966  arginine transporter permease subunit ArtQ  55.61 
 
 
238 aa  221  7e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00873  hypothetical protein  55.61 
 
 
238 aa  221  7e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.202246  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0890  arginine transporter permease subunit ArtQ  55.61 
 
 
238 aa  221  7e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.125832  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2469  arginine transporter permease subunit ArtQ  55.61 
 
 
238 aa  221  8e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.391563  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1378  arginine transporter permease subunit ArtQ  54.26 
 
 
238 aa  219  3e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0926  arginine transporter permease subunit ArtQ  54.71 
 
 
238 aa  218  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.412131  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1043  arginine transporter permease subunit ArtQ  54.71 
 
 
238 aa  218  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.163661  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0961  arginine transporter permease subunit ArtQ  54.71 
 
 
238 aa  218  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1024  arginine transporter permease subunit ArtQ  54.71 
 
 
238 aa  218  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0993  arginine transporter permease subunit ArtQ  54.71 
 
 
238 aa  218  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.908225  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0253  arginine transporter permease subunit ArtQ  52.22 
 
 
223 aa  216  2e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00505088  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1966  arginine transporter permease subunit ArtQ  55.41 
 
 
238 aa  209  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.681186  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1700  arginine transporter permease subunit ArtQ  54.26 
 
 
238 aa  206  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0374298  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2378  arginine transporter permease subunit ArtQ  57.69 
 
 
238 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.677527  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1114  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.93 
 
 
229 aa  193  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.384644  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2278  arginine transporter permease subunit ArtQ  54.26 
 
 
238 aa  188  8e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1593  arginine transport system permease protein  44.24 
 
 
221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.216044  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0592  arginine ABC transporter, permease protein  44.24 
 
 
221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0258675  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2073  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.51 
 
 
246 aa  171  7.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1827  arginine/ornithine ABC transporter, permease protein  36.65 
 
 
229 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.883387  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3570  amino acid ABC transporter permease  35.75 
 
 
229 aa  169  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.906452  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1959  arginine/ornithine periplasmic binding protein-dependent transporter, inner membrane component  36.21 
 
 
246 aa  169  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.450154  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68080  ABC transporter permease  44.09 
 
 
231 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.382503  normal  0.0204508 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5892  ABC transporter permease  44.09 
 
 
231 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003971  arginine/ornithine ABC transporter permease protein AotQ  36.63 
 
 
246 aa  169  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01551  ABC transporter permease protein  36.21 
 
 
246 aa  168  8e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3774  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.39 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134573  hitchhiker  0.00153221 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4291  amino acid ABC transporter permease  35.29 
 
 
229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0328  amino acid ABC transporter permease  41.55 
 
 
244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4137  amino acid ABC transporter, permease protein  37.27 
 
 
237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3990  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.39 
 
 
229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.456811 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4485  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  34.39 
 
 
229 aa  161  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1430  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.39 
 
 
229 aa  161  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0905208  normal  0.971438 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3875  amino acid ABC transporter permease  37.27 
 
 
242 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.426238 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0297  ABC basic amino acid transporter, inner membrane subunit  41.06 
 
 
244 aa  160  1e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2560  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.1 
 
 
230 aa  159  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.645171  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2880  arginine/ornithine transport system permease protein  37.56 
 
 
229 aa  156  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0976589  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0325  arginine ABC transporter, permease protein  43.3 
 
 
231 aa  156  2e-37  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1453  amino acid ABC transporter, permease protein  36.33 
 
 
260 aa  155  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000402633  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52780  arginine/ornithine transport protein AotQ  39.8 
 
 
229 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2832  ABC polar amino acid transporter inner membrane protein  36.48 
 
 
246 aa  155  6e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0885  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.01 
 
 
229 aa  154  9e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.524811 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4625  arginine/ornithine transport protein AotQ  39.3 
 
 
229 aa  154  9e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2567  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.99 
 
 
229 aa  154  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.386415  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2915  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.2 
 
 
229 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1093  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.75 
 
 
229 aa  153  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436853  normal  0.0653327 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0889  amino acid ABC transporter, permease protein  37.56 
 
 
229 aa  153  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3309  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.04 
 
 
234 aa  153  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825201  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1247  histidine transport system permease protein  37.1 
 
 
229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1089  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  37.1 
 
 
229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1094  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  37.1 
 
 
229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.914927  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3017  histidine ABC transporter, permease protein  37.1 
 
 
229 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.606762  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1580  histidine ABC transporter, permease protein  37.1 
 
 
229 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0987  histidine ABC transporter, permease protein  37.1 
 
 
229 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689242  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0310  amino acid ABC transporter permease  39.45 
 
 
231 aa  151  8e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000193986  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4913  amino acid ABC transporter permease  39.73 
 
 
231 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2789  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.61 
 
 
229 aa  149  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.113989  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4929  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.47 
 
 
231 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0205937  hitchhiker  0.0000000789331 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4271  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.73 
 
 
231 aa  149  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000112521 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5359  amino acid ABC transporter, permease protein  40.37 
 
 
231 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2686  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  33.18 
 
 
228 aa  149  5e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503163  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1524  amino acid ABC transporter permease  37.5 
 
 
229 aa  149  5e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3607  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.39 
 
 
229 aa  148  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488418  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1209  amino acid ABC transporter permease  37.27 
 
 
242 aa  148  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1429  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  34.7 
 
 
228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0521843  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0281  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  41.95 
 
 
230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0627068  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_004310  BR0953  amino acid ABC transporter, permease protein  37.21 
 
 
240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.578847  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1539  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.7 
 
 
228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2252  amino acid ABC transporter permease  37.1 
 
 
232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2594  histidine ABC transporter permease HisQ  33.18 
 
 
228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0352  histidine transport system permease HisQ  34.7 
 
 
228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.179299  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2582  histidine ABC transporter permease HisQ  33.18 
 
 
228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.114361 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2703  histidine ABC transporter permease HisQ  33.18 
 
 
228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2540  histidine ABC transporter permease protein HisQ  33.18 
 
 
228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.512507  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0299  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.09 
 
 
230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0837568  normal  0.0626241 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2494  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  33.18 
 
 
228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.174518  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0304  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.09 
 
 
230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0016104  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02233  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  32.73 
 
 
228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1348  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.73 
 
 
228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.120013  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1344  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.73 
 
 
228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.917469  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2458  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  32.73 
 
 
228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02193  hypothetical protein  32.73 
 
 
228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2464  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  32.73 
 
 
228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.796861  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1122  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.94 
 
 
229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2602  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  32.73 
 
 
228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.311053  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3448  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  32.73 
 
 
228 aa  145  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.869706  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3391  ABC basic amino acid transporter, inner membrane subunit  36.49 
 
 
229 aa  145  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2809  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.71 
 
 
239 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.309944  normal  0.926456 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>