More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6914 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6914  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
241 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5921  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  94.19 
 
 
241 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.610786  normal  0.165756 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1828  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  68.97 
 
 
240 aa  317  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300709  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4835  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  68.1 
 
 
240 aa  316  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.716985  normal  0.137601 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5101  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  68.1 
 
 
240 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0381438  decreased coverage  0.00220155 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5750  amino acid ABC transporter permease  69.4 
 
 
240 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6114  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  69.4 
 
 
240 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.606867 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6596  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  69.83 
 
 
240 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.20911 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5839  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  69.4 
 
 
240 aa  299  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5622  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  68.97 
 
 
240 aa  298  5e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129998  normal  0.660092 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2651  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.46 
 
 
240 aa  242  3e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0430594  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1257  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  58.77 
 
 
240 aa  237  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3519  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.07 
 
 
240 aa  234  8e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405389  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5165  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.98 
 
 
232 aa  233  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3872  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.51 
 
 
238 aa  230  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4049  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.07 
 
 
238 aa  228  8e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7240  ABC transporter membrane spanning protein (nopaline)  50.22 
 
 
256 aa  222  4.9999999999999996e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0593694  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4486  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.56 
 
 
232 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.358946  normal  0.0242594 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1589  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.13 
 
 
267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1114  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.44 
 
 
229 aa  180  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.384644  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2073  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.09 
 
 
246 aa  179  4.999999999999999e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1563  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.95 
 
 
237 aa  175  6e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.086799  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3875  amino acid ABC transporter permease  41.41 
 
 
242 aa  174  9e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.426238 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4137  amino acid ABC transporter, permease protein  39.91 
 
 
237 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2290  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.91 
 
 
268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142141  normal  0.98078 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0297  ABC basic amino acid transporter, inner membrane subunit  43.69 
 
 
244 aa  171  1e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2252  amino acid ABC transporter permease  45.45 
 
 
232 aa  171  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7394  ABC transporter membrane spanning protein  38.7 
 
 
240 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.330237  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0328  amino acid ABC transporter permease  43.69 
 
 
244 aa  170  2e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2322  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.74 
 
 
239 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.893058  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2057  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.47 
 
 
268 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28022  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3594  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  39.32 
 
 
239 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2178  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.32 
 
 
239 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.142027  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2236  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.83 
 
 
240 aa  168  7e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2377  ABC His/Glu/Gln/Arg/opine transporter, inner membrane subunit  40.28 
 
 
243 aa  168  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.413222  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0953  amino acid ABC transporter, permease protein  39.13 
 
 
240 aa  168  9e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.578847  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3990  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.32 
 
 
229 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.456811 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4485  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  43.32 
 
 
229 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2809  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.46 
 
 
239 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.309944  normal  0.926456 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1430  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.32 
 
 
229 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0905208  normal  0.971438 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3774  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.4 
 
 
229 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134573  hitchhiker  0.00153221 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1827  arginine/ornithine ABC transporter, permease protein  40.28 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.883387  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3570  amino acid ABC transporter permease  40.28 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.906452  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3607  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.74 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488418  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0281  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  46.12 
 
 
230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0627068  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0299  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.12 
 
 
230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0837568  normal  0.0626241 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4638  amino acid ABC transporter permease  39.81 
 
 
229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5464  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.28 
 
 
229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0304  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.12 
 
 
230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0016104  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3725  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.81 
 
 
229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0898326 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0885  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.89 
 
 
229 aa  162  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.524811 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4291  amino acid ABC transporter permease  40.74 
 
 
229 aa  162  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5892  ABC transporter permease  42.54 
 
 
231 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1209  amino acid ABC transporter permease  39.91 
 
 
242 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3796  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.35 
 
 
229 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.719623  normal  0.0561262 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68080  ABC transporter permease  42.54 
 
 
231 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.382503  normal  0.0204508 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003971  arginine/ornithine ABC transporter permease protein AotQ  37.45 
 
 
246 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2686  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  39.35 
 
 
228 aa  160  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503163  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1410  histidine ABC transporter, permease protein  40.74 
 
 
229 aa  159  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157931  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01551  ABC transporter permease protein  37.02 
 
 
246 aa  159  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02233  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  38.89 
 
 
228 aa  158  7e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1348  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.89 
 
 
228 aa  158  7e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.120013  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02193  hypothetical protein  38.89 
 
 
228 aa  158  7e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4929  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.21 
 
 
231 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0205937  hitchhiker  0.0000000789331 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2602  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  38.89 
 
 
228 aa  157  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.311053  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2464  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  38.89 
 
 
228 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.796861  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3309  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.09 
 
 
234 aa  157  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825201  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1094  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  37.5 
 
 
229 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.914927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1247  histidine transport system permease protein  37.5 
 
 
229 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1089  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  37.5 
 
 
229 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2458  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  38.89 
 
 
228 aa  157  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5068  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 
240 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.458442  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1344  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.89 
 
 
228 aa  157  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.917469  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4913  amino acid ABC transporter permease  44.89 
 
 
231 aa  156  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0889  amino acid ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 
229 aa  156  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3448  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  38.89 
 
 
228 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.869706  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1959  arginine/ornithine periplasmic binding protein-dependent transporter, inner membrane component  38.11 
 
 
246 aa  156  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.450154  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2880  arginine/ornithine transport system permease protein  41.88 
 
 
229 aa  155  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0976589  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1539  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.44 
 
 
228 aa  155  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0987  histidine ABC transporter, permease protein  37.04 
 
 
229 aa  154  9e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689242  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3017  histidine ABC transporter, permease protein  37.04 
 
 
229 aa  154  9e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.606762  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1580  histidine ABC transporter, permease protein  37.04 
 
 
229 aa  154  9e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1791  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.35 
 
 
229 aa  154  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.369418  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0352  histidine transport system permease HisQ  37.44 
 
 
228 aa  154  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.179299  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0483  histidine ABC transporter, permease protein  39.81 
 
 
229 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.158807  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5359  amino acid ABC transporter, permease protein  44 
 
 
231 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1355  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  39.81 
 
 
229 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.556  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0210  histidine ABC transporter, permease protein  39.81 
 
 
229 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1240  histidine ABC transporter, permease protein  39.81 
 
 
229 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.842706  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1089  histidine ABC transporter, permease protein  39.81 
 
 
229 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.518061  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4271  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.54 
 
 
231 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000112521 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2915  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.2 
 
 
229 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1429  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  37.44 
 
 
228 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0521843  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2560  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.79 
 
 
230 aa  154  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.645171  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1093  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.67 
 
 
229 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436853  normal  0.0653327 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2832  ABC polar amino acid transporter inner membrane protein  39.71 
 
 
246 aa  154  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0310  amino acid ABC transporter permease  44 
 
 
231 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000193986  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1524  amino acid ABC transporter permease  40.67 
 
 
229 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2567  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.96 
 
 
229 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.386415  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2791  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  38.71 
 
 
229 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>