200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A2355 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2355  L-arabinose transport system, permease protein  100 
 
 		 485 aa  916    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1626  L-arabinose transporter permease protein  82.79 
 
 		 339 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3208  L-arabinose transporter permease protein  81.97 
 
 		 339 aa  195  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0500809 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5220  L-arabinose transporter permease protein  81.97 
 
 		 341 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4919  L-arabinose transporter permease protein  79.51 
 
 		 339 aa  193  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.259607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5639  L-arabinose transporter permease protein  81.97 
 
 		 341 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.356357  normal  0.0453459 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4590  L-arabinose transporter permease protein  81.97 
 
 		 337 aa  193  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280966 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5474  L-arabinose transporter permease protein  79.51 
 
 		 335 aa  193  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0452809 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4219  L-arabinose transporter permease protein  77.87 
 
 		 338 aa  189  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.645331 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3962  L-arabinose transporter permease protein  75.41 
 
 		 334 aa  187  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0047  L-arabinose transporter permease protein  81.15 
 
 		 339 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.149615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2600  L-arabinose transporter permease protein  76.23 
 
 		 336 aa  157  6e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.860073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3010  L-arabinose transporter permease protein  76.23 
 
 		 336 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2613  L-arabinose transporter permease protein  47.54 
 
 		 338 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727228  normal  0.716925 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2756  L-arabinose transporter permease protein  49.18 
 
 		 335 aa  107  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.394625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2373  L-arabinose transporter permease protein  37.44 
 
 		 329 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00546665  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1021  L-arabinose transporter permease protein  44.91 
 
 		 333 aa  105  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3775  L-arabinose transporter permease protein  49.18 
 
 		 315 aa  105  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1997  L-arabinose transporter permease protein  45.9 
 
 		 349 aa  104  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.254059  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1883  L-arabinose transporter permease protein  45.9 
 
 		 349 aa  104  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2263  L-arabinose transporter permease protein  45.9 
 
 		 349 aa  104  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2640  L-arabinose ABC transporter, permease protein  36.95 
 
 		 329 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0418311  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2585  L-arabinose transporter permease protein  45.9 
 
 		 335 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2995  L-arabinose transporter permease protein  45.9 
 
 		 335 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.397713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2247  L-arabinose transporter permease protein  44.26 
 
 		 327 aa  101  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000358536 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2031  L-arabinose transporter permease protein  45.9 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192716  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3446  L-arabinose transporter permease protein  50 
 
 		 334 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2484  L-arabinose transporter permease protein  50 
 
 		 334 aa  100  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.532923  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3482  L-arabinose transporter permease protein  50 
 
 		 334 aa  100  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.456756  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0404  L-arabinose transporter permease protein  50 
 
 		 334 aa  100  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.15645  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1264  L-arabinose transporter permease protein  50 
 
 		 334 aa  100  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3484  L-arabinose transporter permease protein  50 
 
 		 334 aa  100  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3301  L-arabinose transporter permease protein  50 
 
 		 334 aa  100  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3705  L-arabinose transporter permease protein  50 
 
 		 338 aa  100  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256894  normal  0.416608 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1910  L-arabinose transporter permease protein  44.26 
 
 		 328 aa  99.4  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0524  L-arabinose transporter permease protein  49.18 
 
 		 338 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299001  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0548  L-arabinose transporter permease protein  49.18 
 
 		 338 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0287231  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2331  L-arabinose transporter permease protein  45.08 
 
 		 328 aa  98.6  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266483  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3763  L-arabinose transporter permease protein  45.69 
 
 		 316 aa  98.2  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139254  normal  0.990186 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0548  L-arabinose transporter permease protein  48.31 
 
 		 338 aa  98.2  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0318738  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0140  L-arabinose transporter permease protein  49.18 
 
 		 338 aa  98.2  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.907828  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0623  L-arabinose transporter permease protein  49.18 
 
 		 338 aa  98.2  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000899793  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3409  L-arabinose transporter permease protein  49.15 
 
 		 338 aa  98.6  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0925142  normal  0.0828764 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0591  L-arabinose transporter permease protein  49.18 
 
 		 338 aa  98.2  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257552  normal  0.0412649 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2762  L-arabinose transporter permease protein  48.36 
 
 		 338 aa  97.8  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.84256  normal  0.399817 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1181  L-arabinose transporter permease protein  48.36 
 
 		 334 aa  95.5  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4139  L-arabinose transporter permease protein  41.22 
 
 		 322 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.494868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2147  L-arabinose transporter permease protein  52.33 
 
 		 328 aa  93.6  7e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3475  L-arabinose transporter permease protein  47.41 
 
 		 316 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2635  L-arabinose transporter permease protein  45.08 
 
 		 328 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.348948  hitchhiker  0.00000000000485021 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1023  L-arabinose transporter permease protein  45.08 
 
 		 328 aa  91.3  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1287  L-arabinose transporter permease protein  45.08 
 
 		 328 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00785622  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2130  L-arabinose transporter permease protein  45.08 
 
 		 328 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000455443  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01867  fused L-arabinose transporter subunits of ABC superfamily: membrane components  45.08 
 
 		 329 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1744  Monosaccharide-transporting ATPase  45.08 
 
 		 328 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.629454  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01856  hypothetical protein  45.08 
 
 		 329 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1736  L-arabinose transporter permease protein  45.08 
 
 		 328 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.612736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1995  L-arabinose transporter permease protein  45.08 
 
 		 328 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00340389  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2474  L-arabinose transporter permease protein  44.44 
 
 		 326 aa  88.6  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.552924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3602  L-arabinose transporter permease protein  48.94 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  34.1 
 
 		 322 aa  66.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  29.51 
 
 		 835 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22090  inner-membrane translocator  32.79 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2852  inner-membrane translocator  41.77 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.387266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2077  inner-membrane translocator  38.05 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110578 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1049  inner-membrane translocator  38.94 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.186781  normal  0.0406542 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  38.53 
 
 		 325 aa  59.3  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  36.05 
 
 		 316 aa  59.3  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  33.9 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1988  inner-membrane translocator  29.61 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0171978 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1986  inner-membrane translocator  29.61 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.422562  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  37.72 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2075  inner-membrane translocator  29.61 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.716718  hitchhiker  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7831  sugar ABC transporter membrane protein  40.2 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2090  inner-membrane translocator  36.71 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.268162 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  33.59 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  32.35 
 
 		 311 aa  57  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6089  inner-membrane translocator  38.71 
 
 		 334 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.761591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2570  inner-membrane translocator  34.09 
 
 		 325 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.76 
 
 		 333 aa  56.2  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  43.82 
 
 		 315 aa  56.2  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2057  inner-membrane translocator  30.46 
 
 		 372 aa  56.2  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  31.76 
 
 		 311 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  31.76 
 
 		 311 aa  55.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  31.76 
 
 		 311 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  31.76 
 
 		 311 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  31.76 
 
 		 311 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  31.43 
 
 		 327 aa  55.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  31.76 
 
 		 311 aa  55.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  31.18 
 
 		 311 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  32.58 
 
 		 311 aa  54.3  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  31.18 
 
 		 311 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  32.58 
 
 		 311 aa  54.3  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5198  Monosaccharide-transporting ATPase  36.73 
 
 		 333 aa  54.3  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  35.53 
 
 		 317 aa  54.3  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3165  Monosaccharide-transporting ATPase  37.5 
 
 		 310 aa  53.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2023  inner-membrane translocator  41.25 
 
 		 332 aa  52.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  31.25 
 
 		 331 aa  52.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2149  Monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 372 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.257212  normal  0.232458 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 314 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>