35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_1013 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3670  pentapeptide repeat protein  50.56 
 
 
830 aa  743    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.414516  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0969  hypothetical protein  99.45 
 
 
726 aa  1500    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2440  pentapeptide repeat protein  50.99 
 
 
830 aa  750    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4786  pentapeptide repeat protein  51.7 
 
 
824 aa  730    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1013  hypothetical protein  100 
 
 
726 aa  1507    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2162  hypothetical protein  32.63 
 
 
710 aa  251  4e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26102  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0097  hypothetical protein  30.97 
 
 
719 aa  225  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0544866  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2231  hypothetical protein  30.1 
 
 
702 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0202187  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2277  hypothetical protein  30.08 
 
 
720 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000453679  hitchhiker  0.0000445422 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2222  hypothetical protein  29.39 
 
 
723 aa  208  4e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.747509  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3306  hypothetical protein  23.92 
 
 
662 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000532342  normal  0.261438 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1094  hypothetical protein  25.64 
 
 
588 aa  79  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  22.15 
 
 
593 aa  70.1  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4009  putative ATP-dependent helicase  22.31 
 
 
677 aa  67.8  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00213516  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4891  hypothetical protein  22.5 
 
 
616 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412698  normal  0.98473 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0807  hypothetical protein  21.59 
 
 
616 aa  61.2  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2943  putative DNA/RNA helicase  24.91 
 
 
660 aa  60.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0569603  unclonable  1.9165499999999998e-31 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0809  LexA repressor  23.22 
 
 
815 aa  59.3  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642499  hitchhiker  0.0000861607 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2003  putative ATP-dependent helicase  24.01 
 
 
662 aa  57.8  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.148023  hitchhiker  0.00375343 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4939  DNA helicase II  22.09 
 
 
613 aa  57.4  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891198  normal  0.619317 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1299  NERD domain protein  26.14 
 
 
593 aa  57  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5380  DNA helicase II  20.45 
 
 
619 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3974  hypothetical protein  20.39 
 
 
607 aa  55.5  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.335001 
 
 
-
 
NC_003296  RS02993  hypothetical protein  20.14 
 
 
612 aa  55.1  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145899  normal  0.116581 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0783  hypothetical protein  22.84 
 
 
662 aa  52.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2959  NERD domain-containing protein  21.65 
 
 
625 aa  52.4  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4619  hypothetical protein  21.96 
 
 
615 aa  52  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.502486 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2302  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  24.17 
 
 
607 aa  50.8  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1772  DNA helicase II  22.53 
 
 
619 aa  50.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0076  DNA helicase II  21.28 
 
 
632 aa  50.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4277  DNA helicase II  20.83 
 
 
314 aa  49.3  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.260274  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1680  NERD domain-containing protein  23.98 
 
 
568 aa  47.8  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4005  hypothetical protein  20.16 
 
 
610 aa  45.4  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.467683  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0474  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.57 
 
 
1469 aa  44.3  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.872336  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2691  hypothetical protein  37.74 
 
 
382 aa  44.3  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.486273  normal  0.199519 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>