20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4009 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4009  putative ATP-dependent helicase  100 
 
 		 677 aa  1377    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00213516  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2003  putative ATP-dependent helicase  47.02 
 
 		 662 aa  521  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.148023  hitchhiker  0.00375343 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0783  hypothetical protein  41.52 
 
 		 662 aa  488  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3306  hypothetical protein  41.27 
 
 		 662 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000532342  normal  0.261438 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2943  putative DNA/RNA helicase  39.81 
 
 		 660 aa  435  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0569603  unclonable  1.9165499999999998e-31 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2231  hypothetical protein  24.68 
 
 		 702 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0202187  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2277  hypothetical protein  25.78 
 
 		 720 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000453679  hitchhiker  0.0000445422 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0097  hypothetical protein  23.09 
 
 		 719 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0544866  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2162  hypothetical protein  26.15 
 
 		 710 aa  84.7  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0969  hypothetical protein  22.31 
 
 		 726 aa  74.7  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1013  hypothetical protein  22.31 
 
 		 726 aa  74.7  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2222  hypothetical protein  25.61 
 
 		 723 aa  70.1  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.747509  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3670  pentapeptide repeat protein  22.01 
 
 		 830 aa  64.3  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.414516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4786  pentapeptide repeat protein  22.64 
 
 		 824 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2440  pentapeptide repeat protein  20.99 
 
 		 830 aa  57.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1094  hypothetical protein  23.21 
 
 		 588 aa  57.8  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0729  hypothetical protein  25.18 
 
 		 574 aa  49.3  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0847  hypothetical protein  24.86 
 
 		 549 aa  46.6  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4576  AAA ATPase  24.12 
 
 		 533 aa  45.8  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1680  NERD domain-containing protein  22.81 
 
 		 568 aa  45.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>