More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7149 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7149  putative oligopeptide ABC transporter (permease protein)  100 
 
 		 310 aa  608  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0224  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  90.58 
 
 		 317 aa  564  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.843746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  89.94 
 
 		 317 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0790804 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  88.64 
 
 		 317 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0375695  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3380  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.23 
 
 		 314 aa  493  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0656  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.61 
 
 		 317 aa  425  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3268  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.66 
 
 		 317 aa  421  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.507762  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2702  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.01 
 
 		 317 aa  419  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3793  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.55 
 
 		 317 aa  419  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.335221 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.96 
 
 		 317 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0415626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1440  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.64 
 
 		 317 aa  413  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.2 
 
 		 317 aa  408  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0381  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.48 
 
 		 317 aa  408  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2064  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.48 
 
 		 317 aa  409  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377444 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.78 
 
 		 316 aa  404  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00447351  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0852  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.48 
 
 		 317 aa  395  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.62 
 
 		 334 aa  230  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.12 
 
 		 332 aa  229  5e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7327  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  40.46 
 
 		 306 aa  226  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 		 334 aa  225  8e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3004  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.14 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.26 
 
 		 312 aa  224  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.6 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.62 
 
 		 306 aa  223  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.34 
 
 		 306 aa  222  6e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.14 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1381  transmembrane ABC transporter protein  38.16 
 
 		 307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.796345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.83 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14841  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  36.11 
 
 		 333 aa  220  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0982  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  39.14 
 
 		 306 aa  219  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1092  peptide ABC transporter, permease protein, putative  38.69 
 
 		 314 aa  219  6e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.47 
 
 		 311 aa  218  7.999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.26 
 
 		 313 aa  218  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.95 
 
 		 306 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.535733 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00798  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  38.82 
 
 		 306 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.82 
 
 		 306 aa  217  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.82 
 
 		 306 aa  217  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0889  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  38.82 
 
 		 306 aa  217  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.952014  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0902  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  38.82 
 
 		 306 aa  217  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00815  hypothetical protein  38.82 
 
 		 306 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.558182  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0856  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  38.82 
 
 		 306 aa  217  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 		 307 aa  215  7e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.525141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.23 
 
 		 333 aa  214  9.999999999999999e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.589028 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2517  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  38.49 
 
 		 306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503163  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.59 
 
 		 306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.532863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0951  glutathione ABC transporter permease  38.16 
 
 		 306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.258662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0980  glutathione ABC transporter permease  38.16 
 
 		 306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.96 
 
 		 309 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195869  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1001  glutathione ABC transporter permease  37.83 
 
 		 306 aa  212  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0891  glutathione ABC transporter, permease protein  37.83 
 
 		 306 aa  212  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.976092  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0918  inner membrane ABC transporter permease protein YddR  37.83 
 
 		 306 aa  212  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.34 
 
 		 315 aa  212  7e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.22 
 
 		 315 aa  211  9e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000049983  normal  0.670386 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.17 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 		 306 aa  211  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 		 313 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.18227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.08 
 
 		 326 aa  210  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.467018  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.94 
 
 		 334 aa  210  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000955673 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1492  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.17 
 
 		 306 aa  210  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.16 
 
 		 308 aa  209  4e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1925  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.84 
 
 		 306 aa  209  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.730701  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1835  nickel transporter permease NikB  38.22 
 
 		 314 aa  209  6e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.829834  hitchhiker  0.0019148 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0323  ABC transporter permease protein  36.84 
 
 		 306 aa  208  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 		 306 aa  209  7e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.94 
 
 		 315 aa  209  7e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0976  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  36.84 
 
 		 306 aa  208  8e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00545821  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0240  putative glutathione ABC transporter, permease protein  36.84 
 
 		 306 aa  208  8e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1357  putative glutathione ABC transporter, permease protein  36.84 
 
 		 306 aa  208  8e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255381  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0400  putative glutathione ABC transporter, permease protein  36.84 
 
 		 306 aa  208  8e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.668867  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0719  hypothetical protein  36.01 
 
 		 316 aa  208  1e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.870853 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.35 
 
 		 316 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1114  dipeptide ABC transporter, permease protein, putative  36.84 
 
 		 327 aa  207  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.17 
 
 		 306 aa  208  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.913097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.34 
 
 		 306 aa  207  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.579769  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1766  putative glutathione ABC transporter, permease protein  36.51 
 
 		 306 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1851  ABC transport permease  36.51 
 
 		 306 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.94 
 
 		 334 aa  206  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4817  nickel transporter permease NikB  37.1 
 
 		 314 aa  206  4e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.12 
 
 		 334 aa  206  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.12 
 
 		 313 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.18 
 
 		 306 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6122  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0837  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  36.18 
 
 		 306 aa  206  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.039737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.72 
 
 		 314 aa  205  8e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.207674 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03326  nickel transporter subunit  36.77 
 
 		 314 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3844  nickel transporter permease NikB  36.77 
 
 		 314 aa  204  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0238  nickel ABC transporter, permease subunit NikB  36.77 
 
 		 314 aa  204  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.86 
 
 		 306 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3132  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.69 
 
 		 340 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03279  hypothetical protein  36.77 
 
 		 314 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3959  nickel transporter permease NikB  36.77 
 
 		 314 aa  204  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3676  nickel transporter permease NikB  36.77 
 
 		 314 aa  204  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5121  putative ABC transporter permease protein  36.24 
 
 		 298 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.407731 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0239  nickel transporter permease NikB  36.77 
 
 		 314 aa  204  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 		 313 aa  205  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.380096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.28 
 
 		 320 aa  204  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000183272  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3761  nickel transporter permease NikB  36.77 
 
 		 314 aa  204  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.04 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.01 
 
 		 340 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  37 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>