More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6640 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6640  benzoyl-CoA-dihydrodiol lyase  100 
 
 
562 aa  1153    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0742487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0749  benzoyl-CoA-dihydrodiol lyase  72.97 
 
 
556 aa  828    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4654  benzoyl-CoA-dihydrodiol lyase  69.04 
 
 
562 aa  807    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0671  benzoyl-CoA-dihydrodiol lyase  61.2 
 
 
549 aa  692    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.519849  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1422  benzoyl-CoA-dihydrodiol lyase  57.27 
 
 
556 aa  640    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.314547  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0892  benzoyl-CoA-dihydrodiol lyase  58.03 
 
 
559 aa  640    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.316468  normal  0.0805923 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0880  benzoyl-CoA-dihydrodiol lyase  70.11 
 
 
562 aa  823    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.436676  normal  0.55485 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1222  benzoyl-CoA-dihydrodiol lyase  57.89 
 
 
558 aa  636    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677268  normal  0.0150752 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0743  benzoyl-CoA-dihydrodiol lyase  71.45 
 
 
564 aa  829    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2696  benzoyl-CoA-dihydrodiol lyase  57.45 
 
 
556 aa  639    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1540  benzoyl-CoA-dihydrodiol lyase  57.64 
 
 
560 aa  630  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3907  benzoyl-CoA-dihydrodiol lyase  57.27 
 
 
558 aa  627  1e-178  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0093  benzoyl-CoA-dihydrodiol lyase  57.48 
 
 
558 aa  617  1e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3659  benzoyl-CoA-dihydrodiol lyase  57.12 
 
 
555 aa  611  1e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1325  benzoyl-CoA-dihydrodiol lyase  57.3 
 
 
560 aa  609  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2944  benzoyl-CoA-dihydrodiol lyase  56.2 
 
 
552 aa  609  1e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1628  benzoyl-CoA-dihydrodiol lyase  55.11 
 
 
552 aa  601  1.0000000000000001e-171  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00278933  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0074  benzoyl-CoA-dihydrodiol lyase  55.17 
 
 
556 aa  599  1e-170  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0732  benzoyl-CoA-dihydrodiol lyase  56.06 
 
 
560 aa  600  1e-170  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693691  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0220  benzoyl-CoA-dihydrodiol lyase  56.39 
 
 
575 aa  590  1e-167  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205685  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2008  benzoyl-CoA-dihydrodiol lyase  53.27 
 
 
573 aa  585  1e-166  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274826  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5224  benzoyl-CoA-dihydrodiol lyase  53.2 
 
 
548 aa  553  1e-156  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2829  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.74 
 
 
265 aa  91.7  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.25 
 
 
261 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.58 
 
 
249 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184062  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4079  short chain enoyl-CoA hydratase  31.58 
 
 
249 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4155  short chain enoyl-CoA hydratase  31.58 
 
 
249 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2607  enoyl-CoA hydratase  32.56 
 
 
262 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.43779  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1664  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  35.44 
 
 
717 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0455542  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  29.53 
 
 
259 aa  75.5  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4588  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.69 
 
 
268 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61629  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  30.69 
 
 
260 aa  74.7  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  28.7 
 
 
659 aa  74.3  0.000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  29.63 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  30.18 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.37 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  31.25 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2515  enoyl-CoA hydratase  31.4 
 
 
262 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2552  enoyl-CoA hydratase  31.4 
 
 
262 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2290  enoyl-CoA hydratase  31.98 
 
 
262 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2564  enoyl-CoA hydratase  31.4 
 
 
262 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45986e-17 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2213  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.94 
 
 
257 aa  72.8  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0591948  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  30.41 
 
 
661 aa  72.4  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.94 
 
 
257 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2374  enoyl-CoA hydratase  31.4 
 
 
262 aa  72  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2331  enoyl-CoA hydratase  31.4 
 
 
262 aa  72  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2551  enoyl-CoA hydratase  31.4 
 
 
262 aa  72  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4169  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.67 
 
 
280 aa  71.6  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.68 
 
 
258 aa  71.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1857  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.09 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.172746  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0807  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  30.11 
 
 
738 aa  70.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.35193 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0408  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  27.87 
 
 
724 aa  70.5  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4604  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  29.73 
 
 
738 aa  70.5  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02700  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  31.55 
 
 
719 aa  70.1  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  27.23 
 
 
261 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2881  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  29.71 
 
 
715 aa  69.7  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.452872  normal  0.163686 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.93 
 
 
260 aa  69.3  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1505  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  32.08 
 
 
735 aa  69.3  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.216267 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1743  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  31.87 
 
 
663 aa  68.2  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.987316  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3890  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  31.55 
 
 
711 aa  67.8  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0297605  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3378  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  31.52 
 
 
721 aa  67.4  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.89 
 
 
261 aa  67.4  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4093  short chain enoyl-CoA hydratase  28.93 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0817  short chain enoyl-CoA hydratase / 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  29.38 
 
 
737 aa  67.4  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.85082 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  31.55 
 
 
257 aa  67  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.72 
 
 
260 aa  67  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.33 
 
 
259 aa  67  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1748  short chain enoyl-CoA hydratase  32.32 
 
 
258 aa  67  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.455491  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0017  enoyl-CoA hydratase  27.1 
 
 
261 aa  67  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1663  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.18 
 
 
367 aa  67  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.283423 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1538  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.14 
 
 
255 aa  67  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02265  fused enoyl-CoA hydratase and epimerase and isomerase/3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  29.95 
 
 
714 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2359  enoyl-CoA hydratase  31.98 
 
 
262 aa  66.6  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1316  fatty acid oxidation complex, alpha subunit FadJ  29.95 
 
 
714 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  29.38 
 
 
258 aa  66.6  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0887  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  31.36 
 
 
738 aa  66.6  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.703103  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1645  short chain enoyl-CoA hydratase  31.4 
 
 
257 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  26.7 
 
 
261 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  25.66 
 
 
267 aa  66.6  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1316  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.54 
 
 
260 aa  66.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.200035  normal  0.304816 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02226  hypothetical protein  29.95 
 
 
714 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  28.65 
 
 
662 aa  66.2  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2821  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  32.26 
 
 
727 aa  66.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.16 
 
 
252 aa  65.9  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  29.38 
 
 
258 aa  65.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2111  short chain enoyl-CoA hydratase / 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  32.6 
 
 
714 aa  65.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.344014 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1341  fatty acid oxidation complex, alpha subunit FadJ  30.51 
 
 
732 aa  65.9  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.44 
 
 
257 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.74 
 
 
264 aa  65.1  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  25 
 
 
261 aa  65.1  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0436  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  27.43 
 
 
725 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.977403  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.44 
 
 
257 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.44 
 
 
257 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2637  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  29.95 
 
 
714 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2036  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.36 
 
 
257 aa  65.1  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.44 
 
 
257 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2721  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  29.95 
 
 
714 aa  65.1  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3484  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  29.95 
 
 
714 aa  65.1  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.591904  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1444  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  31.48 
 
 
727 aa  65.1  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2492  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  29.95 
 
 
714 aa  65.1  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>