More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0743 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6640  benzoyl-CoA-dihydrodiol lyase  71.45 
 
 
562 aa  822    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0742487 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0093  benzoyl-CoA-dihydrodiol lyase  59.45 
 
 
558 aa  644    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1325  benzoyl-CoA-dihydrodiol lyase  59.31 
 
 
560 aa  635    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0743  benzoyl-CoA-dihydrodiol lyase  100 
 
 
564 aa  1152    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4654  benzoyl-CoA-dihydrodiol lyase  81.51 
 
 
562 aa  944    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0671  benzoyl-CoA-dihydrodiol lyase  64.48 
 
 
549 aa  741    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.519849  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1540  benzoyl-CoA-dihydrodiol lyase  58.99 
 
 
560 aa  657    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1628  benzoyl-CoA-dihydrodiol lyase  57.5 
 
 
552 aa  637    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00278933  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1422  benzoyl-CoA-dihydrodiol lyase  58.76 
 
 
556 aa  664    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.314547  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0892  benzoyl-CoA-dihydrodiol lyase  58.62 
 
 
559 aa  660    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.316468  normal  0.0805923 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0880  benzoyl-CoA-dihydrodiol lyase  80.61 
 
 
562 aa  939    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.436676  normal  0.55485 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2696  benzoyl-CoA-dihydrodiol lyase  58.91 
 
 
556 aa  659    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1222  benzoyl-CoA-dihydrodiol lyase  59 
 
 
558 aa  665    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677268  normal  0.0150752 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3907  benzoyl-CoA-dihydrodiol lyase  56.71 
 
 
558 aa  640    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3659  benzoyl-CoA-dihydrodiol lyase  59.93 
 
 
555 aa  648    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0749  benzoyl-CoA-dihydrodiol lyase  78.2 
 
 
556 aa  883    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2944  benzoyl-CoA-dihydrodiol lyase  57.53 
 
 
552 aa  635    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0732  benzoyl-CoA-dihydrodiol lyase  57.48 
 
 
560 aa  628  1e-179  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693691  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0220  benzoyl-CoA-dihydrodiol lyase  57.74 
 
 
575 aa  622  1e-177  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205685  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2008  benzoyl-CoA-dihydrodiol lyase  55.73 
 
 
573 aa  619  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274826  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0074  benzoyl-CoA-dihydrodiol lyase  56.08 
 
 
556 aa  612  9.999999999999999e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5224  benzoyl-CoA-dihydrodiol lyase  54.18 
 
 
548 aa  566  1e-160  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2829  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.02 
 
 
265 aa  91.7  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  33.51 
 
 
259 aa  81.3  0.00000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1857  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.56 
 
 
270 aa  77  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.172746  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1664  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  29.6 
 
 
717 aa  74.7  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0455542  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  30.81 
 
 
260 aa  73.6  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4079  short chain enoyl-CoA hydratase  29.65 
 
 
249 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  30.49 
 
 
659 aa  73.2  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2111  short chain enoyl-CoA hydratase / 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  30.1 
 
 
714 aa  73.2  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.344014 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.65 
 
 
249 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184062  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4155  short chain enoyl-CoA hydratase  29.65 
 
 
249 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  32.28 
 
 
260 aa  72.4  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2787  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.25 
 
 
258 aa  72.4  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01709  fatty oxidation complex alpha subunit  30.73 
 
 
693 aa  72  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  33.16 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2337  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
280 aa  70.5  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0655331  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1316  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.93 
 
 
260 aa  70.1  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.200035  normal  0.304816 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  33.16 
 
 
258 aa  70.1  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30 
 
 
261 aa  70.1  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  31.95 
 
 
262 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.76 
 
 
269 aa  68.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.25 
 
 
259 aa  68.9  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  28.21 
 
 
261 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  32.99 
 
 
263 aa  68.6  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2607  enoyl-CoA hydratase  32.56 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.43779  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.03 
 
 
259 aa  68.2  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  30.69 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3938  short chain enoyl-CoA hydratase  33.54 
 
 
254 aa  67.8  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.525947 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2552  enoyl-CoA hydratase  32.56 
 
 
262 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.8 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  33.54 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3378  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  28.84 
 
 
721 aa  67.4  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0690  putative fatty oxidation complex, alpha subunit  29.55 
 
 
675 aa  67.4  0.0000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2515  enoyl-CoA hydratase  31.98 
 
 
262 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  31.25 
 
 
262 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.46 
 
 
257 aa  67.4  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  27.75 
 
 
261 aa  67  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.63 
 
 
258 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1505  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  28.5 
 
 
735 aa  66.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.216267 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2374  enoyl-CoA hydratase  31.98 
 
 
262 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2551  enoyl-CoA hydratase  31.98 
 
 
262 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6109  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  35.77 
 
 
718 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.403763  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2564  enoyl-CoA hydratase  31.98 
 
 
262 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45986e-17 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4588  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.34 
 
 
268 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61629  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.75 
 
 
259 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2331  enoyl-CoA hydratase  31.98 
 
 
262 aa  65.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  26.73 
 
 
261 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.83 
 
 
260 aa  65.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  26.73 
 
 
261 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  26.73 
 
 
261 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4225  enoyl-CoA hydratase  28.34 
 
 
267 aa  65.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.76 
 
 
264 aa  65.9  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  26.73 
 
 
261 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.37 
 
 
264 aa  65.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1487  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  29.55 
 
 
683 aa  65.9  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.432075  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  26.73 
 
 
261 aa  65.1  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.55 
 
 
252 aa  65.5  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3890  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  33.54 
 
 
711 aa  65.1  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0297605  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.32 
 
 
260 aa  65.1  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02700  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  33.74 
 
 
719 aa  65.1  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  26.61 
 
 
261 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  27.06 
 
 
297 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  27.06 
 
 
297 aa  65.1  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2290  enoyl-CoA hydratase  31.4 
 
 
262 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  26.61 
 
 
261 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  31.79 
 
 
661 aa  64.7  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0807  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  30.91 
 
 
738 aa  64.7  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.35193 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30240  short chain enoyl-CoA hydratase /3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  30.77 
 
 
728 aa  65.1  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  27.06 
 
 
297 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.61 
 
 
261 aa  64.7  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  26.61 
 
 
261 aa  64.7  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  26.61 
 
 
261 aa  64.7  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1547  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  30.85 
 
 
637 aa  64.3  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000330184  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.1 
 
 
262 aa  63.9  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678896  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2604  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  32.29 
 
 
724 aa  64.3  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110209  normal  0.266065 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4604  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  32.12 
 
 
738 aa  63.9  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  27.24 
 
 
267 aa  63.9  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  27.66 
 
 
261 aa  63.9  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0915  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  32.75 
 
 
719 aa  63.9  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.572647  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>