21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_8332 on replicon NC_011982
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011982  Avi_8332  conjugal transfer protein TrbD  100 
 
 		 99 aa  196  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.514686  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9267  conjugal transfer protein TrbD  84.85 
 
 		 99 aa  174  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4567  conjugal transfer protein TrbD  76.77 
 
 		 99 aa  157  5e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5378  conjugal transfer protein TrbD  78.26 
 
 		 98 aa  149  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.832169  normal  0.316362 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5484  conjugal transfer protein TrbD  72.73 
 
 		 99 aa  147  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9658  conjugal transfer protein TrbD  69.39 
 
 		 99 aa  136  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6504  conjugal transfer protein TrbD  52.94 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136548  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6633  conjugal transfer protein TrbD  52.94 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000138876  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4272  conjugal transfer protein TrbD  52.94 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000000000615182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2227  conjugal transfer protein TrbD  46.51 
 
 		 106 aa  88.2  4e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00500311  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0049  conjugal transfer protein TrbD  43.53 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.635043  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2502  conjugal transfer TrbD family protein  33 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1618  Conjugal transfer TrbD family protein  32.56 
 
 		 98 aa  63.5  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1837  putative conjugal transfer TrbD transmembrane protein  36.84 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7743  conjugal transfer protein TrbD  36.84 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.24167 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0964  putative conjugal transfer protein TrbD  34.18 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2029  putative conjugal transfer TrbD transmembrane protein  31.65 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.563542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2270  conjugal transfer protein TrbD  36.62 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3196  conjugal transfer protein TrbB  40.85 
 
 		 93 aa  40.8  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.285316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3693  type IV secretory pathway, VirB3 family protein  34.62 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3899  type IV secretory pathway, VirB3-like  36.62 
 
 		 93 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.539501  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>