50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1829 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1829  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  100 
 
 		 144 aa  296  6e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.579415  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1491  MutT/nudix family protein  46.67 
 
 		 153 aa  111  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.627971  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1445  MutT/nudix family protein  45.93 
 
 		 153 aa  110  9e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1677  NUDIX hydrolase  48.44 
 
 		 146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0887736  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1924  mutT/nudix family protein  38.68 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2102  mutT/nudix family protein  38.68 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1876  MutT/Nudix family protein  38.68 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2071  mutT/nudix family protein  38.68 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2170  mutT/nudix family protein  37.74 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.625771  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2142  mutT/nudix family protein  37.74 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.10318  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1886  MutT/Nudix family protein  36.79 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1920  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.234524  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3248  mutT/nudix family protein  34.58 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00145388  normal  0.225138 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2060  mutT/nudix family protein  34.91 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0210595  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1558  NUDIX hydrolase  34.58 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248131  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3273  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1932  NUDIX hydrolase  42.25 
 
 		 221 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2153  NUDIX family hydrolase  37.93 
 
 		 173 aa  45.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  29.7 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1221  NUDIX hydrolase  40.85 
 
 		 221 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  29.7 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3542  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0543257  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2415  NUDIX hydrolase  48.28 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000842745  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0494  NUDIX hydrolase  44.26 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1854  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 163 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 		 143 aa  41.2  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2125  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  28.97 
 
 		 301 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0450  MutT/NUDIX family protein  45.24 
 
 		 164 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290469  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4889  hypothetical protein  39.62 
 
 		 337 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  51.52 
 
 		 186 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0331  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0454  MutT/NUDIX family protein  40 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000159368  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2492  mutT/nudix family protein  32.58 
 
 		 148 aa  40.4  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802073  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0542  mutT/nudix family protein  45.24 
 
 		 164 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000238457  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0673  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 		 191 aa  40.8  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0511  mutT/nudix family protein  45.24 
 
 		 164 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0633443  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0064  A/G-specific adenine glycosylase  66.67 
 
 		 435 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0542  mutT/nudix family protein  45.24 
 
 		 153 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16009e-47 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  35.48 
 
 		 301 aa  40.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 175 aa  40.4  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0578  mutT/nudix family protein  45.24 
 
 		 153 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4043  NUDIX hydrolase  32.88 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.62945  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4118  NUDIX hydrolase  32.88 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1988  NUDIX hydrolase  44 
 
 		 164 aa  40.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0344946  normal  0.279217 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3895  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 165 aa  40.4  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4272  NUDIX hydrolase  32.88 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841219  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>