46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0782 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0782  ParB domain protein nuclease  100 
 
 		 171 aa  358  1e-98  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1537  transcriptional regulator  62.43 
 
 		 180 aa  233  1.0000000000000001e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000676852  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1248  transcriptional regulator  61.18 
 
 		 175 aa  224  4e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0643  IbrB protein  50 
 
 		 205 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0701  IbrB protein  50 
 
 		 205 aa  165  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0435547 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0657  IbrB protein  50 
 
 		 205 aa  165  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0762  IbrB protein  50 
 
 		 205 aa  165  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.405862  normal  0.534854 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0716  hypothetical protein  50 
 
 		 205 aa  165  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3181  hypothetical protein  48.8 
 
 		 190 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3042  nuclease  48.19 
 
 		 205 aa  160  6e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00569  hypothetical protein  48.19 
 
 		 209 aa  160  7e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.059764  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00558  hypothetical protein  48.19 
 
 		 209 aa  160  7e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0559756  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37080  hypothetical protein  46.71 
 
 		 211 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0622  immunoglobulin-binding regulator family protein  48.19 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0622  IbrB protein  48.19 
 
 		 205 aa  159  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0687  IbrB protein  47.59 
 
 		 209 aa  158  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3023  ParB domain protein nuclease  47.59 
 
 		 205 aa  158  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0653  IbrB protein  47.59 
 
 		 205 aa  158  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.707032  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1577  ParB domain protein nuclease  44.44 
 
 		 205 aa  155  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3152  immunoglobulin-binding regulator B  44.58 
 
 		 214 aa  144  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.884386  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02174  hypothetical protein  44.85 
 
 		 209 aa  144  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.545726  normal  0.0735933 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1386  immunoglobulin-binding regulator B homolog  44.58 
 
 		 212 aa  142  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.38868 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1925  immunoglobulin-binding regulator  38.41 
 
 		 208 aa  136  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0504  IbrB  49.43 
 
 		 102 aa  94.7  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0506  IbrB protein  50.72 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  38.33 
 
 		 291 aa  48.5  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1638  ParB-like nuclease  27.56 
 
 		 417 aa  48.9  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0822558  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  37.36 
 
 		 293 aa  46.2  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  33.33 
 
 		 290 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  35.59 
 
 		 303 aa  44.7  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1596  parB-like partition protein  41.82 
 
 		 554 aa  44.7  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.259007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5238  parB-like partition protein  41.82 
 
 		 554 aa  44.7  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0018  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 296 aa  43.9  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0417799  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  32.84 
 
 		 290 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3847  nuclease  31.03 
 
 		 374 aa  43.5  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.298073  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  31.88 
 
 		 290 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2411  ParB domain protein nuclease  28.42 
 
 		 284 aa  42.4  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000114974  normal  0.682432 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  31.34 
 
 		 290 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  24.34 
 
 		 295 aa  42.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4332  ParB family protein  26.61 
 
 		 451 aa  42  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0105  effector of nucleoid occlusion Noc  38.46 
 
 		 322 aa  41.6  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000144978  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0015  parB-like partition protein  28.99 
 
 		 296 aa  41.2  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000218674  hitchhiker  0.000314098 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5942  parB-like partition protein  26.09 
 
 		 295 aa  41.2  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5407  parB-like partition protein  37.5 
 
 		 377 aa  40.8  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  37.29 
 
 		 294 aa  40.8  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  37.29 
 
 		 294 aa  40.8  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>