25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3152 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3152  immunoglobulin-binding regulator B  100 
 
 		 214 aa  443  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.884386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1386  immunoglobulin-binding regulator B homolog  90.19 
 
 		 212 aa  402  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.38868 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00569  hypothetical protein  55.56 
 
 		 209 aa  241  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.059764  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00558  hypothetical protein  55.56 
 
 		 209 aa  241  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0559756  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0643  IbrB protein  60.61 
 
 		 205 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3042  nuclease  58.88 
 
 		 205 aa  241  9e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0701  IbrB protein  60.61 
 
 		 205 aa  240  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0435547 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0716  hypothetical protein  60.61 
 
 		 205 aa  240  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0657  IbrB protein  60.61 
 
 		 205 aa  240  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0622  IbrB protein  58.38 
 
 		 205 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0762  IbrB protein  60.1 
 
 		 205 aa  238  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.405862  normal  0.534854 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0622  immunoglobulin-binding regulator family protein  58.38 
 
 		 205 aa  238  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0687  IbrB protein  54.63 
 
 		 209 aa  237  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3023  ParB domain protein nuclease  56.85 
 
 		 205 aa  235  4e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0653  IbrB protein  56.85 
 
 		 205 aa  235  4e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.707032  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37080  hypothetical protein  54.84 
 
 		 211 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3181  hypothetical protein  52.97 
 
 		 190 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02174  hypothetical protein  50.81 
 
 		 209 aa  196  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.545726  normal  0.0735933 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0782  ParB domain protein nuclease  44.58 
 
 		 171 aa  144  8.000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1925  immunoglobulin-binding regulator  39.16 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1537  transcriptional regulator  44.65 
 
 		 180 aa  135  5e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000676852  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1248  transcriptional regulator  45.57 
 
 		 175 aa  135  5e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1577  ParB domain protein nuclease  45.22 
 
 		 205 aa  135  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0504  IbrB  66.67 
 
 		 102 aa  132  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0506  IbrB protein  50.52 
 
 		 117 aa  112  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>