24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0506 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E0506  IbrB protein  100 
 
 		 117 aa  246  8e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3023  ParB domain protein nuclease  98.23 
 
 		 205 aa  235  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0653  IbrB protein  98.23 
 
 		 205 aa  235  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.707032  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0622  immunoglobulin-binding regulator family protein  96.46 
 
 		 205 aa  233  8e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0622  IbrB protein  95.58 
 
 		 205 aa  231  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0687  IbrB protein  95.58 
 
 		 209 aa  231  3e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00558  hypothetical protein  94.69 
 
 		 209 aa  229  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0559756  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00569  hypothetical protein  94.69 
 
 		 209 aa  229  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.059764  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3042  nuclease  94.69 
 
 		 205 aa  229  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0762  IbrB protein  73.45 
 
 		 205 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.405862  normal  0.534854 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0643  IbrB protein  72.57 
 
 		 205 aa  181  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0657  IbrB protein  71.68 
 
 		 205 aa  179  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0716  hypothetical protein  71.68 
 
 		 205 aa  179  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0701  IbrB protein  71.68 
 
 		 205 aa  179  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0435547 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1386  immunoglobulin-binding regulator B homolog  55.67 
 
 		 212 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.38868 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37080  hypothetical protein  54.46 
 
 		 211 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3181  hypothetical protein  52.58 
 
 		 190 aa  114  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3152  immunoglobulin-binding regulator B  50.52 
 
 		 214 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.884386  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02174  hypothetical protein  47.62 
 
 		 209 aa  106  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.545726  normal  0.0735933 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0782  ParB domain protein nuclease  50.72 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1577  ParB domain protein nuclease  48.39 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1925  immunoglobulin-binding regulator  45.07 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1537  transcriptional regulator  50.85 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000676852  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1248  transcriptional regulator  50.85 
 
 		 175 aa  62  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>