28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1537 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1537  transcriptional regulator  100 
 
 		 180 aa  374  1e-103  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000676852  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1248  transcriptional regulator  84.57 
 
 		 175 aa  313  9e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0782  ParB domain protein nuclease  62.43 
 
 		 171 aa  233  1.0000000000000001e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1577  ParB domain protein nuclease  43.83 
 
 		 205 aa  149  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0622  immunoglobulin-binding regulator family protein  50.67 
 
 		 205 aa  149  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3023  ParB domain protein nuclease  50 
 
 		 205 aa  148  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0653  IbrB protein  50 
 
 		 205 aa  148  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.707032  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3042  nuclease  48.39 
 
 		 205 aa  148  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00558  hypothetical protein  48.1 
 
 		 209 aa  148  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0559756  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00569  hypothetical protein  48.1 
 
 		 209 aa  148  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.059764  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0687  IbrB protein  50 
 
 		 209 aa  148  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0622  IbrB protein  50 
 
 		 205 aa  148  5e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0701  IbrB protein  47.47 
 
 		 205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0435547 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0643  IbrB protein  47.47 
 
 		 205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0716  hypothetical protein  47.47 
 
 		 205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0657  IbrB protein  47.47 
 
 		 205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02174  hypothetical protein  49.02 
 
 		 209 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.545726  normal  0.0735933 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0762  IbrB protein  47.47 
 
 		 205 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.405862  normal  0.534854 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37080  hypothetical protein  46.06 
 
 		 211 aa  143  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3181  hypothetical protein  45.18 
 
 		 190 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1386  immunoglobulin-binding regulator B homolog  45.91 
 
 		 212 aa  136  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.38868 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3152  immunoglobulin-binding regulator B  44.65 
 
 		 214 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.884386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1925  immunoglobulin-binding regulator  35.8 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0504  IbrB  51.76 
 
 		 102 aa  92.4  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0506  IbrB protein  50.85 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1638  ParB-like nuclease  29.27 
 
 		 417 aa  52  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0822558  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1542  parB-like partition protein  33.78 
 
 		 294 aa  45.4  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000160995  unclonable  1.80022e-19 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  35.71 
 
 		 296 aa  41.2  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>