28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_00569 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00569  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  434  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.059764  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00558  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  434  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0559756  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0687  IbrB protein  98.56 
 
 		 209 aa  430  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3042  nuclease  100 
 
 		 205 aa  426  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3023  ParB domain protein nuclease  98.05 
 
 		 205 aa  421  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0622  immunoglobulin-binding regulator family protein  98.54 
 
 		 205 aa  421  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0622  IbrB protein  98.54 
 
 		 205 aa  422  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0653  IbrB protein  98.05 
 
 		 205 aa  421  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.707032  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0643  IbrB protein  78.05 
 
 		 205 aa  344  5e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0762  IbrB protein  78.05 
 
 		 205 aa  343  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.405862  normal  0.534854 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0657  IbrB protein  77.56 
 
 		 205 aa  342  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0716  hypothetical protein  77.56 
 
 		 205 aa  342  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0701  IbrB protein  77.56 
 
 		 205 aa  342  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0435547 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1386  immunoglobulin-binding regulator B homolog  57.48 
 
 		 212 aa  249  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.38868 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3152  immunoglobulin-binding regulator B  55.56 
 
 		 214 aa  241  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.884386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0506  IbrB protein  94.69 
 
 		 117 aa  229  3e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37080  hypothetical protein  51.94 
 
 		 211 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3181  hypothetical protein  52.63 
 
 		 190 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02174  hypothetical protein  50 
 
 		 209 aa  210  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.545726  normal  0.0735933 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0504  IbrB  100 
 
 		 102 aa  201  5e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1577  ParB domain protein nuclease  41.46 
 
 		 205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0782  ParB domain protein nuclease  48.19 
 
 		 171 aa  160  1e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1537  transcriptional regulator  48.1 
 
 		 180 aa  148  6e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000676852  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1925  immunoglobulin-binding regulator  42.33 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1248  transcriptional regulator  46.71 
 
 		 175 aa  141  8e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1638  ParB-like nuclease  24.5 
 
 		 417 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0822558  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0006  ParB family chromosome partioning protein  40 
 
 		 279 aa  42  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.269835  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5405  parB-like partition protein  25.71 
 
 		 477 aa  41.2  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.469576 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>