25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1386 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1386  immunoglobulin-binding regulator B homolog  100 
 
 		 212 aa  440  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.38868 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3152  immunoglobulin-binding regulator B  90.19 
 
 		 214 aa  402  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.884386  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00569  hypothetical protein  57.48 
 
 		 209 aa  249  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.059764  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00558  hypothetical protein  57.48 
 
 		 209 aa  249  3e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0559756  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3042  nuclease  60.91 
 
 		 205 aa  246  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0687  IbrB protein  56.54 
 
 		 209 aa  244  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0622  immunoglobulin-binding regulator family protein  60.41 
 
 		 205 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0643  IbrB protein  61.11 
 
 		 205 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0622  IbrB protein  59.9 
 
 		 205 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0701  IbrB protein  61.11 
 
 		 205 aa  242  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0435547 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0716  hypothetical protein  61.11 
 
 		 205 aa  242  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0657  IbrB protein  61.11 
 
 		 205 aa  242  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3023  ParB domain protein nuclease  59.39 
 
 		 205 aa  241  5e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0653  IbrB protein  59.39 
 
 		 205 aa  241  5e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.707032  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0762  IbrB protein  60.61 
 
 		 205 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.405862  normal  0.534854 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37080  hypothetical protein  53.97 
 
 		 211 aa  208  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3181  hypothetical protein  52.66 
 
 		 190 aa  208  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02174  hypothetical protein  51.06 
 
 		 209 aa  199  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.545726  normal  0.0735933 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0782  ParB domain protein nuclease  44.58 
 
 		 171 aa  142  5e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1577  ParB domain protein nuclease  46.5 
 
 		 205 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1537  transcriptional regulator  45.91 
 
 		 180 aa  136  3.0000000000000003e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000676852  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1925  immunoglobulin-binding regulator  36.96 
 
 		 208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1248  transcriptional regulator  46.2 
 
 		 175 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0504  IbrB  66.67 
 
 		 102 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0506  IbrB protein  55.67 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>