28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C0716 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A0701  IbrB protein  100 
 
 		 205 aa  425  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0435547 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0716  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  425  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0657  IbrB protein  100 
 
 		 205 aa  425  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0643  IbrB protein  99.02 
 
 		 205 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0762  IbrB protein  97.56 
 
 		 205 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.405862  normal  0.534854 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00569  hypothetical protein  77.56 
 
 		 209 aa  342  2e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.059764  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00558  hypothetical protein  77.56 
 
 		 209 aa  342  2e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0559756  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3042  nuclease  77.56 
 
 		 205 aa  342  2e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0622  immunoglobulin-binding regulator family protein  77.56 
 
 		 205 aa  341  4e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3023  ParB domain protein nuclease  77.07 
 
 		 205 aa  340  8e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0653  IbrB protein  77.07 
 
 		 205 aa  340  8e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.707032  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0622  IbrB protein  77.07 
 
 		 205 aa  340  1e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0687  IbrB protein  77.07 
 
 		 209 aa  340  1e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1386  immunoglobulin-binding regulator B homolog  61.11 
 
 		 212 aa  242  3e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.38868 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3152  immunoglobulin-binding regulator B  60.61 
 
 		 214 aa  240  9e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.884386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37080  hypothetical protein  55.44 
 
 		 211 aa  216  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3181  hypothetical protein  53.16 
 
 		 190 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02174  hypothetical protein  50.78 
 
 		 209 aa  205  5e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.545726  normal  0.0735933 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0506  IbrB protein  71.68 
 
 		 117 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0504  IbrB  80.41 
 
 		 102 aa  168  6e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0782  ParB domain protein nuclease  50 
 
 		 171 aa  165  5e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1577  ParB domain protein nuclease  49.35 
 
 		 205 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1537  transcriptional regulator  47.47 
 
 		 180 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000676852  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1248  transcriptional regulator  46.45 
 
 		 175 aa  141  7e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1925  immunoglobulin-binding regulator  41.61 
 
 		 208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1638  ParB-like nuclease  26.49 
 
 		 417 aa  45.4  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0822558  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4248  parB-like partition protein  26.32 
 
 		 294 aa  45.1  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00203372  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3964  parB-like partition protein  26.39 
 
 		 292 aa  42.4  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.20429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>