25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02174 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02174  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  426  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.545726  normal  0.0735933 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37080  hypothetical protein  66.83 
 
 		 211 aa  282  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3181  hypothetical protein  65.97 
 
 		 190 aa  260  8e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00569  hypothetical protein  50 
 
 		 209 aa  210  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.059764  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00558  hypothetical protein  50 
 
 		 209 aa  210  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0559756  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3042  nuclease  50 
 
 		 205 aa  210  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3023  ParB domain protein nuclease  49.5 
 
 		 205 aa  209  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0653  IbrB protein  49.5 
 
 		 205 aa  209  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.707032  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0687  IbrB protein  49.5 
 
 		 209 aa  208  5e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0622  IbrB protein  49.5 
 
 		 205 aa  208  6e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0622  immunoglobulin-binding regulator family protein  49 
 
 		 205 aa  207  9e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0716  hypothetical protein  50.78 
 
 		 205 aa  205  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0701  IbrB protein  50.78 
 
 		 205 aa  205  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0435547 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0657  IbrB protein  50.78 
 
 		 205 aa  205  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0643  IbrB protein  50.78 
 
 		 205 aa  204  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0762  IbrB protein  50.26 
 
 		 205 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.405862  normal  0.534854 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1386  immunoglobulin-binding regulator B homolog  51.06 
 
 		 212 aa  199  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.38868 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3152  immunoglobulin-binding regulator B  50.81 
 
 		 214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.884386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1537  transcriptional regulator  49.02 
 
 		 180 aa  145  3e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000676852  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0782  ParB domain protein nuclease  44.85 
 
 		 171 aa  144  8.000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1248  transcriptional regulator  46.39 
 
 		 175 aa  141  7e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1577  ParB domain protein nuclease  45.62 
 
 		 205 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1925  immunoglobulin-binding regulator  29.81 
 
 		 208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0504  IbrB  52.08 
 
 		 102 aa  108  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0506  IbrB protein  47.62 
 
 		 117 aa  106  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>