30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_37080 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_37080  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3181  hypothetical protein  87.96 
 
 		 190 aa  349  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02174  hypothetical protein  66.83 
 
 		 209 aa  282  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.545726  normal  0.0735933 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00569  hypothetical protein  51.94 
 
 		 209 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.059764  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00558  hypothetical protein  51.94 
 
 		 209 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0559756  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3042  nuclease  53.89 
 
 		 205 aa  219  3e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0687  IbrB protein  51.94 
 
 		 209 aa  218  5e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3023  ParB domain protein nuclease  53.89 
 
 		 205 aa  218  6e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0653  IbrB protein  53.89 
 
 		 205 aa  218  6e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.707032  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0622  IbrB protein  53.37 
 
 		 205 aa  217  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0622  immunoglobulin-binding regulator family protein  53.37 
 
 		 205 aa  216  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0701  IbrB protein  55.44 
 
 		 205 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0435547 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0716  hypothetical protein  55.44 
 
 		 205 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0657  IbrB protein  55.44 
 
 		 205 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0643  IbrB protein  55.44 
 
 		 205 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0762  IbrB protein  54.92 
 
 		 205 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.405862  normal  0.534854 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3152  immunoglobulin-binding regulator B  54.84 
 
 		 214 aa  209  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.884386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1386  immunoglobulin-binding regulator B homolog  53.97 
 
 		 212 aa  208  5e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.38868 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0782  ParB domain protein nuclease  46.71 
 
 		 171 aa  160  2e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1577  ParB domain protein nuclease  51.55 
 
 		 205 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1537  transcriptional regulator  46.06 
 
 		 180 aa  143  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000676852  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1248  transcriptional regulator  46.39 
 
 		 175 aa  141  8e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1925  immunoglobulin-binding regulator  30.62 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0506  IbrB protein  54.46 
 
 		 117 aa  118  6e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0504  IbrB  52.13 
 
 		 102 aa  104  8e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4698  parB-like partition proteins  30.71 
 
 		 368 aa  46.2  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0006  ParB family chromosome partioning protein  29.29 
 
 		 279 aa  42.7  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.269835  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0656  parB-like partition protein  27.21 
 
 		 362 aa  42.7  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.235927  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  28.75 
 
 		 290 aa  41.6  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0509  parB-like partition protein  29.46 
 
 		 284 aa  41.2  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>