216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4932 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4932  glycerate kinase  100 
 
 		 383 aa  720    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4561  glycerate kinase  59.69 
 
 		 387 aa  387  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.532738 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2192  conserved hypothetical protein TIGR00045  52.34 
 
 		 394 aa  364  1e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00342258  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2238  conserved hypothetical protein TIGR00045  52.08 
 
 		 394 aa  363  4e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.61483e-31 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2054  hypothetical protein  52.08 
 
 		 394 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2210  hypothetical protein  52.08 
 
 		 394 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.583334  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0404  glycerate kinase  51.59 
 
 		 381 aa  326  4.0000000000000003e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0467091  decreased coverage  0.00777473 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3398  glycerate kinase  48.9 
 
 		 380 aa  316  3e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13407  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2145  glycerate kinase  51.86 
 
 		 399 aa  316  5e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.741997  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3529  glycerate kinase  49.73 
 
 		 384 aa  315  6e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22950  Glycerate kinase  46.11 
 
 		 380 aa  301  8.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1860  Glycerate kinase  47.23 
 
 		 388 aa  298  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.817432  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3279  glycerate kinase 2  46.97 
 
 		 380 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.809605  normal  0.297665 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3165  glycerate kinase 2  46.97 
 
 		 380 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589174  normal  0.0595423 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2594  glycerate kinase  44.44 
 
 		 379 aa  296  6e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3118  glycerate kinase 2  46.7 
 
 		 380 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855661  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3181  glycerate kinase 2  46.7 
 
 		 380 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.345716  normal  0.43286 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3291  Glycerate kinase  46.11 
 
 		 380 aa  293  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000409322  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06943  hypothetical glycerate kinase (Eurofung)  50.44 
 
 		 338 aa  293  5e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1142  glycerate kinase  46.2 
 
 		 382 aa  292  7e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.45984  unclonable  0.0000000352544 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3100  glycerate kinase 2  46.44 
 
 		 380 aa  292  8e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1524  glycerate kinase  43.92 
 
 		 380 aa  290  4e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3566  glycerate kinase I  45.5 
 
 		 381 aa  288  9e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.816007 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4052  glycerate kinase  45.63 
 
 		 378 aa  288  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4081  glycerate kinase  45.63 
 
 		 378 aa  287  2e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.063717 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3419  glycerate kinase I  44.21 
 
 		 381 aa  286  4e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3602  glycerate kinase I  43.95 
 
 		 381 aa  286  5e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4436  glycerate kinase I  43.95 
 
 		 381 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.109938 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0111  glycerate kinase  45.35 
 
 		 378 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02989  glycerate kinase I  43.95 
 
 		 408 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0581  Glycerate kinase  43.95 
 
 		 381 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0151  glycerate kinase  51.41 
 
 		 381 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219073  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0846  hypothetical protein  42.25 
 
 		 373 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0245025  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0576  glycerate kinase I  43.95 
 
 		 381 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02940  hypothetical protein  43.95 
 
 		 408 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3313  glycerate kinase I  43.95 
 
 		 381 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2685  glycerate kinase  46.61 
 
 		 379 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3392  glycerate kinase  44.17 
 
 		 381 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2858  glycerate kinase  46.34 
 
 		 379 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.368112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2726  glycerate kinase  46.61 
 
 		 379 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2637  glycerate kinase  46.61 
 
 		 379 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06863  glycerate kinase  46.24 
 
 		 377 aa  282  5.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3551  glycerate kinase  44.17 
 
 		 387 aa  282  6.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1896  glycerate kinase  40.75 
 
 		 384 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000882  glycerate kinase  45.6 
 
 		 378 aa  282  7.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0854  glycerate kinase  42.25 
 
 		 373 aa  282  7.000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69696  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1380  Glycerate kinase  50.99 
 
 		 379 aa  281  1e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.824242 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0871  glycerate 2-kinase  39.79 
 
 		 380 aa  280  2e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2534  glycerate kinase  44.74 
 
 		 381 aa  280  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3234  glycerate kinase I  43.16 
 
 		 381 aa  280  3e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3115  glycerate kinase  46.65 
 
 		 379 aa  280  4e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.630245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2915  glycerate kinase  47.43 
 
 		 383 aa  279  7e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0846  glycerate kinase  44.33 
 
 		 380 aa  276  4e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0578  glycerate kinase II  44.41 
 
 		 382 aa  276  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.837942 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3623  glycerate kinase  41.51 
 
 		 386 aa  276  6e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.304163  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0571  glycerate kinase II  44.41 
 
 		 382 aa  276  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0632  glycerate kinase II  44.41 
 
 		 382 aa  275  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.82847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0573  glycerate kinase II  44.41 
 
 		 382 aa  275  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2685  Glycerate kinase  46.09 
 
 		 381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0334  hypothetical protein  45.33 
 
 		 377 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2714  glycerate kinase  43.46 
 
 		 384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426289  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3134  glycerate kinase  43.89 
 
 		 392 aa  273  3e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500551 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0201  glycerate kinase  47.76 
 
 		 394 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3228  glycerate kinase  45.29 
 
 		 384 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0890898  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4326  hypothetical protein  49.29 
 
 		 381 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0260902  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03503  glycerate kinase  47.53 
 
 		 389 aa  272  9e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3280  glycerate kinase  44.97 
 
 		 379 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345259  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0262  glycerate kinase 2  48.02 
 
 		 388 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0173  glycerate kinase  48.02 
 
 		 388 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1637  glycerate kinase 1  48.02 
 
 		 388 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2908  glycerate kinase  45.58 
 
 		 379 aa  270  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4927  glycerate kinase  46.48 
 
 		 395 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2519  glycerate kinase  41.99 
 
 		 381 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122569 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43390  Glycerate kinase  46.92 
 
 		 378 aa  270  2.9999999999999997e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00316811  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1439  glycerate kinase  48.56 
 
 		 380 aa  269  5e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0615  glycerate kinase II  43.35 
 
 		 381 aa  269  7e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0559  glycerate kinase II  43.62 
 
 		 381 aa  269  8e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00464  glycerate kinase II  43.35 
 
 		 381 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00469  hypothetical protein  43.35 
 
 		 381 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2779  glycerate kinase  41.41 
 
 		 394 aa  267  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3239  glycerate 2-kinase  43.62 
 
 		 379 aa  267  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0551  glycerate kinase II  43.35 
 
 		 381 aa  268  2e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3099  Glycerate kinase  43.35 
 
 		 381 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3109  glycerate kinase II  43.35 
 
 		 381 aa  265  1e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2690  glycerate kinase  45.04 
 
 		 379 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0812  glycerate kinase  45.07 
 
 		 380 aa  265  1e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2685  glycerate kinase  41.73 
 
 		 381 aa  265  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384968 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0587  glycerate kinase II  43.35 
 
 		 381 aa  265  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5139  glycerate kinase  42.09 
 
 		 381 aa  263  3e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00182361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2642  glycerate kinase  41.53 
 
 		 389 aa  263  4e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.809212  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1770  glycerate kinase, putative  41.93 
 
 		 384 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2587  glycerate kinase  42.26 
 
 		 381 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1470  glycerate kinase  40.46 
 
 		 394 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3178  glycerate kinase  44.71 
 
 		 379 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1478  glycerate kinase  41.6 
 
 		 378 aa  260  3e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0147  glycerate kinase  40.38 
 
 		 381 aa  260  3e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0153  glycerate kinase  40.65 
 
 		 381 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0197  glycerate kinase  41.81 
 
 		 381 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0775115  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0793  glycerate kinase 2  38.13 
 
 		 380 aa  258  2e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.109169  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0148  glycerate kinase  41.53 
 
 		 385 aa  257  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>