More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_4286 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_4286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
316 aa  646    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  98.1 
 
 
316 aa  634    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4447  NAD-dependent epimerase/dehydratase  98.1 
 
 
316 aa  637    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.633837  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  86.36 
 
 
314 aa  559  1e-158  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1542  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.88 
 
 
335 aa  451  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.920861  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2127  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.83 
 
 
314 aa  373  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2096  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  57.05 
 
 
314 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.644928  hitchhiker  0.0000124933 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3544  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.34 
 
 
312 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.95 
 
 
314 aa  366  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.467345  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.95 
 
 
314 aa  367  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.118371 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.34 
 
 
312 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3396  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.25 
 
 
312 aa  364  1e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.312565 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1041  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.26 
 
 
318 aa  355  6.999999999999999e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.19 
 
 
314 aa  355  7.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198534  normal  0.135614 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0035  GDP-fucose synthetase  40.79 
 
 
312 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0178713 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.26 
 
 
320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.04 
 
 
323 aa  252  6e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.429243  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3150  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.25 
 
 
324 aa  251  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5688  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.58 
 
 
313 aa  249  4e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.874346 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0060  GDP-fucose synthetase  40.98 
 
 
308 aa  248  7e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.396896  normal  0.0281476 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1091  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.02 
 
 
309 aa  248  9e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0426  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.23 
 
 
316 aa  248  9e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.63 
 
 
324 aa  248  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.721722  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.6 
 
 
311 aa  246  3e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0386838  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1700  GDP-fucose synthetase NAD dependent epimerase/dehydratase  39.87 
 
 
314 aa  246  4e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.231068  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.72 
 
 
318 aa  246  4e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0627  GDP-fucose synthetase  42.38 
 
 
314 aa  245  8e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0865  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.26 
 
 
309 aa  243  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.043091  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1828  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.08 
 
 
306 aa  243  3.9999999999999997e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0122431 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0081  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.58 
 
 
321 aa  242  6e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.384606 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0822  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.13 
 
 
319 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.99 
 
 
312 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0624  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.6 
 
 
308 aa  240  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2842  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.59 
 
 
324 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0619  GDP-fucose synthetase  36.39 
 
 
308 aa  240  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5160  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.44 
 
 
312 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195142  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.49 
 
 
321 aa  239  4e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.08 
 
 
313 aa  239  5e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.235303  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.41 
 
 
321 aa  238  6.999999999999999e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.757489 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0411  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.31 
 
 
314 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.45 
 
 
312 aa  238  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.144888  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2092  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.3 
 
 
322 aa  236  3e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3862  putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  39.48 
 
 
319 aa  236  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2350  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.33 
 
 
312 aa  235  6e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4620  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.79 
 
 
312 aa  235  9e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000717233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2362  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.74 
 
 
313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000746713  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.89 
 
 
324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.221885  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0962  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.89 
 
 
324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14451  putative fucose synthetase  37.62 
 
 
337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.638706  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0361  fucose synthetase family protein  38.54 
 
 
326 aa  233  4.0000000000000004e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0252323  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.49 
 
 
322 aa  232  5e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0418  fucose synthetase family protein  38.54 
 
 
326 aa  232  6e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0709177  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4753  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.16 
 
 
324 aa  230  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.69 
 
 
317 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3371  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.94 
 
 
326 aa  230  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.67 
 
 
335 aa  229  4e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1084  putative GDP-fucose synthetase  39.74 
 
 
316 aa  229  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2470  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.14 
 
 
331 aa  229  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.482517 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2695  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.96 
 
 
321 aa  229  6e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0303782 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1147  GDP-L-fucose synthetase  39.1 
 
 
322 aa  228  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.91 
 
 
306 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.881493 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.67 
 
 
314 aa  228  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.660712  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.96 
 
 
345 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.141904 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3442  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.33 
 
 
310 aa  227  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.22 
 
 
356 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.435131  normal  0.526104 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.95 
 
 
324 aa  226  5.0000000000000005e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.37 
 
 
319 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00831994  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3209  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.85 
 
 
347 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14001  putative fucose synthetase  35.74 
 
 
322 aa  225  6e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.881279  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2845  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.99 
 
 
308 aa  224  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00578096  normal  0.490082 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3040  GDP-L-fucose synthetase  36.71 
 
 
321 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3182  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.71 
 
 
321 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.092333  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1253  GDP-L-fucose synthetase  36.71 
 
 
321 aa  223  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000974466  hitchhiker  0.000000000000993367 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14001  putative fucose synthetase  37.09 
 
 
320 aa  223  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2666  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.71 
 
 
321 aa  222  7e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.350076 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1234  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.21 
 
 
310 aa  221  9e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2900  GDP-fucose synthetase NAD dependent epimerase/dehydratase  37.21 
 
 
311 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4219  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.07 
 
 
309 aa  221  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0747  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.19 
 
 
311 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4108  putative nucleotide di-P-sugar epimerase or dehydratase  39.16 
 
 
320 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353388  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4142  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.75 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.58 
 
 
337 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1315  NAD dependent epimerase/dehydratase  36.39 
 
 
332 aa  220  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6328  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.58 
 
 
305 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0254  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.51 
 
 
329 aa  219  6e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3270  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.42 
 
 
316 aa  218  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0450  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.29 
 
 
333 aa  218  1e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0947626  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1282  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.04 
 
 
320 aa  217  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5711  GDP-4-dehydro-6-deoxy-D-mannose epimerase /GDP-4-dehydro-6-L-deoxygalactose reductase  37.79 
 
 
316 aa  217  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0771  bifunctional GDP-fucose synthetase: GDP-4-dehydro-6-deoxy-D-mannose epimerase and GDP-4-dehydro-6-L-deoxygalactose reductase  35.76 
 
 
322 aa  217  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0933619 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0651  GDP-L-fucose synthetase  37.34 
 
 
323 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.193687  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1313  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.39 
 
 
320 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01958  bifunctional GDP-fucose synthetase: GDP-4-dehydro-6-deoxy-D-mannose epimerase/ GDP-4-dehydro-6-L-deoxygalactose reductase  35.44 
 
 
321 aa  216  4e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.881949  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1605  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.44 
 
 
321 aa  216  4e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.171954  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01947  hypothetical protein  35.44 
 
 
321 aa  216  4e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.62 
 
 
376 aa  216  5e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000078339  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1010  GDP-L-fucose synthetase  35.13 
 
 
321 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2730  GDP-L-fucose synthetase  36.34 
 
 
326 aa  215  7e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2345  GDP-L-fucose synthetase  35.13 
 
 
321 aa  215  9e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2987  GDP-L-fucose synthetase  35.13 
 
 
321 aa  215  9e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>