More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_14001 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_14001  putative fucose synthetase  100 
 
 
320 aa  646    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0060  GDP-fucose synthetase  49.34 
 
 
308 aa  315  6e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.396896  normal  0.0281476 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1091  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.49 
 
 
309 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.03 
 
 
313 aa  311  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.235303  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.74 
 
 
311 aa  310  2e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0386838  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0865  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.68 
 
 
309 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.043091  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5688  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.03 
 
 
313 aa  310  2.9999999999999997e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.874346 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.87 
 
 
320 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.67 
 
 
312 aa  305  7e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.83 
 
 
312 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.144888  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0426  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.15 
 
 
316 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0418  fucose synthetase family protein  51.37 
 
 
326 aa  303  2.0000000000000002e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0709177  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0361  fucose synthetase family protein  51.37 
 
 
326 aa  304  2.0000000000000002e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0252323  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.08 
 
 
306 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.881493 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5160  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.67 
 
 
312 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195142  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0035  GDP-fucose synthetase  48.05 
 
 
312 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0178713 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4620  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.49 
 
 
312 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000717233 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0822  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.03 
 
 
319 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14001  putative fucose synthetase  50 
 
 
322 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.881279  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3209  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.2 
 
 
347 aa  300  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0627  GDP-fucose synthetase  46.67 
 
 
314 aa  299  4e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.85 
 
 
356 aa  299  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.435131  normal  0.526104 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0254  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.15 
 
 
329 aa  299  5e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1084  putative GDP-fucose synthetase  47.7 
 
 
316 aa  299  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2695  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.79 
 
 
321 aa  298  6e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0303782 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1234  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.15 
 
 
310 aa  297  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1700  GDP-fucose synthetase NAD dependent epimerase/dehydratase  44.63 
 
 
314 aa  297  1e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.231068  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3862  putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  47.04 
 
 
319 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0624  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.63 
 
 
308 aa  298  1e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4242  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.82 
 
 
311 aa  298  1e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0896711  normal  0.0692369 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4219  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.15 
 
 
309 aa  298  1e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2350  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.81 
 
 
312 aa  297  1e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0081  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.42 
 
 
321 aa  297  2e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.384606 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2384  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.74 
 
 
316 aa  296  2e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.73165  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2900  GDP-fucose synthetase NAD dependent epimerase/dehydratase  43.37 
 
 
311 aa  297  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.41 
 
 
314 aa  297  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.660712  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.15 
 
 
345 aa  295  5e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.141904 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4108  putative nucleotide di-P-sugar epimerase or dehydratase  44.84 
 
 
320 aa  295  5e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353388  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.75 
 
 
318 aa  295  6e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.85 
 
 
319 aa  294  1e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00831994  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1282  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.03 
 
 
320 aa  294  1e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2362  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.76 
 
 
313 aa  294  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000746713  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.41 
 
 
323 aa  293  3e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.429243  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2842  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.99 
 
 
324 aa  292  7e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3442  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.74 
 
 
310 aa  291  9e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1828  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.22 
 
 
306 aa  291  1e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0122431 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3371  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.63 
 
 
326 aa  291  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.97 
 
 
376 aa  290  2e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000078339  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5711  GDP-4-dehydro-6-deoxy-D-mannose epimerase /GDP-4-dehydro-6-L-deoxygalactose reductase  44.52 
 
 
316 aa  289  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0450  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.97 
 
 
333 aa  290  3e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0947626  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3182  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.52 
 
 
321 aa  290  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.092333  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3040  GDP-L-fucose synthetase  46.52 
 
 
321 aa  290  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1864  GDP-L-fucose synthetase  45.87 
 
 
319 aa  289  4e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0411  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.33 
 
 
314 aa  289  4e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1253  GDP-L-fucose synthetase  46.2 
 
 
321 aa  288  7e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000974466  hitchhiker  0.000000000000993367 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2845  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.75 
 
 
308 aa  288  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00578096  normal  0.490082 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3150  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.81 
 
 
324 aa  287  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.26 
 
 
324 aa  287  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.221885  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0962  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.26 
 
 
324 aa  287  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.95 
 
 
324 aa  288  1e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.55 
 
 
317 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.81 
 
 
337 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1315  NAD dependent epimerase/dehydratase  47.13 
 
 
332 aa  286  4e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4753  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.61 
 
 
324 aa  286  5e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1147  GDP-L-fucose synthetase  43.13 
 
 
322 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.37 
 
 
324 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.721722  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2470  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.57 
 
 
331 aa  285  9e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.482517 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2092  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.34 
 
 
322 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2967  GDP-L-fucose synthetase  46.45 
 
 
321 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000296227 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1313  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.87 
 
 
320 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0619  GDP-fucose synthetase  45.72 
 
 
308 aa  283  2.0000000000000002e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4142  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.71 
 
 
313 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6328  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.81 
 
 
305 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.45 
 
 
321 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3270  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.1 
 
 
316 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.89 
 
 
325 aa  281  9e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.6044  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1235  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.32 
 
 
320 aa  280  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.95 
 
 
321 aa  279  5e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.757489 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0651  GDP-L-fucose synthetase  44.84 
 
 
323 aa  278  6e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.193687  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3191  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.95 
 
 
324 aa  278  7e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26933  normal  0.010449 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2116  putative nucleotide di-P-sugar epimerase or dehydratase  48.03 
 
 
319 aa  278  8e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.987047 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3361  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.17 
 
 
366 aa  278  9e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.54 
 
 
322 aa  278  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2345  GDP-L-fucose synthetase  44.19 
 
 
321 aa  276  3e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1010  GDP-L-fucose synthetase  44.19 
 
 
321 aa  276  3e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01958  bifunctional GDP-fucose synthetase: GDP-4-dehydro-6-deoxy-D-mannose epimerase/ GDP-4-dehydro-6-L-deoxygalactose reductase  43.87 
 
 
321 aa  276  4e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.881949  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1605  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.87 
 
 
321 aa  276  4e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.171954  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01947  hypothetical protein  43.87 
 
 
321 aa  276  4e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14451  putative fucose synthetase  45.85 
 
 
337 aa  276  4e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.638706  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2987  GDP-L-fucose synthetase  43.87 
 
 
321 aa  275  5e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201772 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02915  GDP-fucose synthetase  42.98 
 
 
362 aa  275  6e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0734964  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1180  GDP-L-fucose synthetase  44.19 
 
 
321 aa  275  8e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1589  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.19 
 
 
321 aa  275  8e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2334  GDP-L-fucose synthetase  43.87 
 
 
321 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.371509 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2341  GDP-L-fucose synthetase  43.87 
 
 
321 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2666  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.55 
 
 
321 aa  273  3e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.350076 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2233  GDP-L-fucose synthetase  43.87 
 
 
321 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.487603  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2448  GDP-L-fucose synthetase  43.87 
 
 
321 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0192641 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2290  GDP-L-fucose synthetase  43.87 
 
 
321 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.711318  normal  0.0100272 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11546  nucleotide-sugar epimerase epiA  41.31 
 
 
322 aa  271  1e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>