133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1995 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1995  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 71 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000194045  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1184  transcriptional regulator, XRE family  98.59 
 
 		 71 aa  142  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1800  Cro/CI family transcriptional regulator  57.97 
 
 		 75 aa  91.3  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3657  transcriptional regulator, XRE family  63.49 
 
 		 79 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.544629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0014  transcriptional regulator, XRE family  54.41 
 
 		 73 aa  80.9  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127273  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0066  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 262 aa  68.2  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0684  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2123  hypothetical protein  38.81 
 
 		 69 aa  64.3  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49660  hypothetical protein  47.54 
 
 		 70 aa  63.5  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000595514  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0963  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 74 aa  63.5  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000305628 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0251  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 72 aa  63.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120803  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4458  putative transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 		 71 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1035  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3255  transcriptional regulator, XRE family  43.48 
 
 		 69 aa  61.2  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3364  transcriptional regulator, XRE family  42.65 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2160  hypothetical protein  46.77 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.419766  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0373  Cro/CI family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 71 aa  60.5  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000000821993  normal  0.249392 
 
 
 
NC_009438  Sputcn32_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  40.3 
 
 		 68 aa  60.5  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3980  transcriptional regulator  40 
 
 		 76 aa  60.5  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3957  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 		 94 aa  60.1  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.010777  normal  0.26793 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4120  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 80 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.424691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4286  Cro/CI family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 73 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4807  helix-turn-helix domain-containing protein  45.9 
 
 		 74 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125806  hitchhiker  0.00510188 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4792  XRE family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 71 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0662158  normal  0.716445 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3005  DNA-binding protein  37.68 
 
 		 71 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0924  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.385099  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2316  Cro/CI family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 69 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.723017  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0975  putative transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 68 aa  58.5  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3417  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0314  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 74 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203005  normal  0.441895 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0028  XRE family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 73 aa  57.8  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230002  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3040  DNA-binding protein  37.68 
 
 		 71 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.119109  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2791  DNA-binding protein  35.21 
 
 		 71 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0381729  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2740  Cro/CI family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 71 aa  57.4  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.29378  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2721  Cro/CI family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 71 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3003  DNA-binding protein  35.21 
 
 		 71 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0902628  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3038  DNA-binding protein  35.21 
 
 		 71 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121923  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3001  DNA-binding protein  35.21 
 
 		 71 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000935469 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18370  predicted transcriptional regulator  40.91 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.312817 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2236  DNA-binding protein  36.23 
 
 		 71 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.972034  hitchhiker  0.0000000327322 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1982  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 74 aa  57  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.995083  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4838  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 71 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1037  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 74 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2806  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3642  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 82 aa  55.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182949  normal  0.278552 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3478  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0540861  normal  0.173042 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0168  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2285  Cro/CI family transcription regulator  37.14 
 
 		 74 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5346  putative transcriptional regulator, XRE family  42.03 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.413727 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0033  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.656945  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0918  DNA-binding protein  35.29 
 
 		 72 aa  53.9  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3550  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 77 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1496  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000868778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4482  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 82 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.111215  normal  0.686525 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1951  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0335085 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4332  helix-turn-helix type 3  35.29 
 
 		 77 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2988  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 74 aa  52  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.962229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4237  putative transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 84 aa  52  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0543061 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0937  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 74 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.792674  normal  0.0631359 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2804  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425929  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0630  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 69 aa  52.8  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.054738  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2888  putative transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 93 aa  51.6  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139071  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3592  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 68 aa  51.6  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0305  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 80 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00365078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2300  putative transcriptional regulatory protein  35.71 
 
 		 74 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3008  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 76 aa  51.2  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2169  hypothetical protein  35.71 
 
 		 74 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0666173  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2209  transcription regulator, Cro/CI family -related protein  32.86 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1666  aspartate/glutamate/uridylate kinase-like protein  33.33 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.962131  hitchhiker  0.00000000000435388 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0100  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 		 70 aa  51.2  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5760  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 71 aa  50.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205139  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2733  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 70 aa  50.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2665  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0037  Transcriptional Regulator, XRE family  34.25 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110571  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2718  putative transcriptional regulator  38.71 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.973938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2194  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135264  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1539  transcriptional regulator, XRE family  33.8 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0419417 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4238  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5453  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.816575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3037  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.548242 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2707  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 78 aa  49.7  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0218  transcription regulator, Cro/CI family -related protein  30.88 
 
 		 76 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5459  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0131549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2649  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5711  transcriptional regulator, XRE family  32.31 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0302  transcriptional regulator  34.38 
 
 		 225 aa  47.8  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.41457  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2650  transcriptional regulator, XRE family  31.88 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.213866  normal  0.098962 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1757  XRE family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0997  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5039  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 74 aa  47.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.927312 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2183  XRE family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 71 aa  47.8  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28080  putative transcriptional regulator  34.33 
 
 		 72 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00426893  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0337  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 83 aa  47.8  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.160189  normal  0.0633386 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3870  transcriptional regulator, XRE family protein  31.88 
 
 		 69 aa  47  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1981  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 68 aa  47  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.287792  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1440  XRE family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 78 aa  47  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1665  XRE family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 74 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.542106  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3131  transcriptional regulator, XRE family  31.82 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5017  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1216  putative HTH-type transcriptional regulator  32.31 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.893532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>