42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_5017 on replicon NC_009973
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009973  Haur_5017  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 77 aa  159  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1800  Cro/CI family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 75 aa  63.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0963  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 74 aa  57.4  0.00000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000305628 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0251  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 72 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120803  n/a   
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0037  Transcriptional Regulator, XRE family  36.71 
 
 		 90 aa  51.6  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110571  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1951  XRE family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0335085 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0373  Cro/CI family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000000821993  normal  0.249392 
 
 
 
NC_012917  PC1_2707  transcriptional regulator, XRE family  30.88 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  31.15 
 
 		 68 aa  47  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0764  XRE family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 79 aa  46.2  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0359167  normal  0.203575 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1995  transcriptional regulator, XRE family  30.43 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000194045  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1184  transcriptional regulator, XRE family  30.43 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2733  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 70 aa  46.2  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0684  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 89 aa  47  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0086  hypothetical protein  32.86 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.417163  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2316  Cro/CI family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.723017  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2806  transcriptional regulator, XRE family  34.21 
 
 		 81 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1539  transcriptional regulator, XRE family  26.76 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0419417 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0014  transcriptional regulator, XRE family  27.54 
 
 		 73 aa  44.7  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127273  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4286  Cro/CI family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 73 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5880  hypothetical protein  27.78 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000665769 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2358  hypothetical protein  27.4 
 
 		 78 aa  42.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000081812  decreased coverage  0.0000157362 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0168  XRE family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3255  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 69 aa  42.7  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1666  aspartate/glutamate/uridylate kinase-like protein  30.77 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.962131  hitchhiker  0.00000000000435388 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2160  hypothetical protein  30.88 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.419766  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4482  XRE family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.111215  normal  0.686525 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5760  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205139  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2665  transcriptional regulator, XRE family  31.94 
 
 		 74 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2650  transcriptional regulator, XRE family  27.03 
 
 		 82 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.213866  normal  0.098962 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3642  XRE family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 82 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182949  normal  0.278552 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4838  transcriptional regulator, XRE family  36.54 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0924  XRE family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 77 aa  41.2  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.385099  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71330  putative transcriptional regulator  29.85 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1216  putative HTH-type transcriptional regulator  28.17 
 
 		 75 aa  41.2  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.893532  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6190  putative transcriptional regulator  29.85 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876157  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2804  XRE family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425929  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0997  transcriptional regulator, XRE family  28.99 
 
 		 69 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4332  helix-turn-helix type 3  29.41 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11560  predicted transcriptional regulator  30 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2853  putative transcriptional regulator, XRE family  25.93 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4807  helix-turn-helix domain-containing protein  31.15 
 
 		 74 aa  40  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125806  hitchhiker  0.00510188 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>