27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2649 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2649  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 80 aa  166  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5453  transcriptional regulator, XRE family  81.25 
 
 		 80 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.816575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3037  transcriptional regulator, XRE family  81.25 
 
 		 80 aa  138  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.548242 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0305  transcriptional regulator, XRE family  80 
 
 		 80 aa  133  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00365078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4838  transcriptional regulator, XRE family  80 
 
 		 71 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5459  transcriptional regulator, XRE family  68.75 
 
 		 92 aa  120  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0131549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1496  transcriptional regulator, XRE family  84.85 
 
 		 75 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000868778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3923  transcriptional regulator, XRE family  82.76 
 
 		 58 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.551914  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4807  helix-turn-helix domain-containing protein  47.62 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125806  hitchhiker  0.00510188 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0764  XRE family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0359167  normal  0.203575 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1184  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1995  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000194045  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0302  transcriptional regulator  36.51 
 
 		 225 aa  47.4  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.41457  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2316  Cro/CI family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 69 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.723017  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0963  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000305628 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3980  transcriptional regulator  39.68 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49660  hypothetical protein  33.33 
 
 		 70 aa  45.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000595514  n/a   
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0037  Transcriptional Regulator, XRE family  36.11 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110571  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4458  putative transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0373  Cro/CI family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000000821993  normal  0.249392 
 
 
 
NC_013422  Hneap_0975  putative transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 68 aa  44.3  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  34.92 
 
 		 68 aa  43.5  0.0009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0251  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120803  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4286  Cro/CI family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1800  Cro/CI family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 75 aa  40  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0816  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 69 aa  40  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2870  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 69 aa  40  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000158683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>