100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0302 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0302  transcriptional regulator  100 
 
 		 225 aa  448  1e-125  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.41457  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0963  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 74 aa  60.5  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000305628 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0684  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3642  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 82 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182949  normal  0.278552 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1695  transcriptional regulator  34.85 
 
 		 70 aa  52.4  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0597679  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1951  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 82 aa  51.2  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0335085 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3478  transcriptional regulator, XRE family  29.58 
 
 		 76 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0540861  normal  0.173042 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3040  DNA-binding protein  30.43 
 
 		 71 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.119109  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3598  helix-turn-helix type 3  34.92 
 
 		 77 aa  49.7  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3364  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 106 aa  50.1  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3005  DNA-binding protein  30.43 
 
 		 71 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0924  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 77 aa  49.3  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.385099  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2123  hypothetical protein  33.82 
 
 		 69 aa  48.9  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6190  putative transcriptional regulator  39.06 
 
 		 68 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876157  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71330  putative transcriptional regulator  39.06 
 
 		 68 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2718  putative transcriptional regulator  33.87 
 
 		 78 aa  48.5  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.973938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3038  DNA-binding protein  28.99 
 
 		 71 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121923  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1216  putative HTH-type transcriptional regulator  30.51 
 
 		 75 aa  47.8  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.893532  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2236  DNA-binding protein  28.99 
 
 		 71 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.972034  hitchhiker  0.0000000327322 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3001  DNA-binding protein  28.99 
 
 		 71 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000935469 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3255  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 69 aa  47.8  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1539  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 71 aa  48.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0419417 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1995  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 71 aa  47.8  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000194045  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1184  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 71 aa  47.8  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2791  DNA-binding protein  28.99 
 
 		 71 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0381729  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2740  Cro/CI family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 71 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.29378  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2721  Cro/CI family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 71 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0490  hypothetical protein  33.33 
 
 		 78 aa  47.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0337  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 83 aa  47.8  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.160189  normal  0.0633386 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0466  hypothetical protein  33.33 
 
 		 78 aa  47.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3003  DNA-binding protein  28.99 
 
 		 71 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0902628  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1665  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 74 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.542106  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2649  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 80 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0997  transcriptional regulator, XRE family  31.75 
 
 		 69 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0100  transcriptional regulator, XRE family  29.23 
 
 		 70 aa  47  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2804  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 75 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425929  n/a   
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0037  Transcriptional Regulator, XRE family  34.38 
 
 		 90 aa  47  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110571  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2135  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 82 aa  47  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.160527 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3870  transcriptional regulator, XRE family protein  34.43 
 
 		 69 aa  47  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0375  XRE family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 76 aa  46.6  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2806  transcriptional regulator, XRE family  25 
 
 		 81 aa  46.6  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4838  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 71 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0816  transcriptional regulator, XRE family  31.82 
 
 		 69 aa  46.6  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2870  transcriptional regulator, XRE family  31.82 
 
 		 69 aa  46.6  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000158683  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0251  transcriptional regulator, XRE family  31.82 
 
 		 72 aa  46.6  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120803  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4481  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 69 aa  46.6  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2160  hypothetical protein  33.87 
 
 		 89 aa  46.2  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.419766  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4120  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 80 aa  46.2  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.424691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3417  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 77 aa  45.8  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3037  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 80 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.548242 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0484  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 77 aa  45.8  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5453  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 80 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.816575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5039  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 74 aa  46.2  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.927312 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1757  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 74 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0033  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 86 aa  45.4  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.656945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05290  predicted transcriptional regulator  32.84 
 
 		 85 aa  45.4  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0478  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 70 aa  45.1  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0373  Cro/CI family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 71 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000000821993  normal  0.249392 
 
 
 
NC_009674  Bcer98_3550  XRE family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 77 aa  44.3  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1496  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 75 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000868778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0788  transcriptional regulator, Cro/CI family  30.16 
 
 		 76 aa  44.7  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3957  transcriptional regulator, XRE family  28.36 
 
 		 94 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.010777  normal  0.26793 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0764  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 79 aa  44.3  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0359167  normal  0.203575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5346  putative transcriptional regulator, XRE family  32.31 
 
 		 79 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.413727 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0630  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 69 aa  44.7  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.054738  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4237  putative transcriptional regulator, XRE family  29.03 
 
 		 84 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0543061 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1800  Cro/CI family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 75 aa  44.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3592  XRE family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 68 aa  45.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1037  transcriptional regulator, XRE family  31.75 
 
 		 74 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0937  transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 		 74 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.792674  normal  0.0631359 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2285  Cro/CI family transcription regulator  33.33 
 
 		 74 aa  43.5  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5459  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 92 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0131549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0314  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 74 aa  43.5  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203005  normal  0.441895 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1982  transcriptional regulator, XRE family  29.23 
 
 		 74 aa  44.3  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.995083  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1981  XRE family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 68 aa  43.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.287792  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2665  transcriptional regulator, XRE family  29.23 
 
 		 74 aa  43.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2209  transcription regulator, Cro/CI family -related protein  28.57 
 
 		 72 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1666  aspartate/glutamate/uridylate kinase-like protein  31.75 
 
 		 67 aa  43.5  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.962131  hitchhiker  0.00000000000435388 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3980  transcriptional regulator  28.79 
 
 		 76 aa  43.5  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2194  XRE family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 72 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135264  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05360  transcriptional regulator, Cro/CI family protein  32.31 
 
 		 68 aa  42.7  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0918  DNA-binding protein  30.16 
 
 		 72 aa  43.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2650  transcriptional regulator, XRE family  28.36 
 
 		 82 aa  43.1  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.213866  normal  0.098962 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4238  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 69 aa  42.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0477  XRE family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 204 aa  43.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.566181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2733  transcriptional regulator, XRE family  26.15 
 
 		 70 aa  42.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4458  putative transcriptional regulator, XRE family  29.41 
 
 		 71 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4482  XRE family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 82 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.111215  normal  0.686525 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0303  transcriptional regulator  36.76 
 
 		 76 aa  42.7  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0351382  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2300  putative transcriptional regulatory protein  33.33 
 
 		 74 aa  42.4  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18370  predicted transcriptional regulator  27.69 
 
 		 78 aa  42.4  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.312817 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4332  helix-turn-helix type 3  29.23 
 
 		 77 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2169  hypothetical protein  33.33 
 
 		 74 aa  42.4  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0666173  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3882  XRE family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 63 aa  42  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4401  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 76 aa  42.4  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0014  transcriptional regulator, XRE family  28.79 
 
 		 73 aa  42  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127273  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3657  transcriptional regulator, XRE family  32.76 
 
 		 79 aa  42  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.544629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2262  XRE family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 68 aa  42  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.914675  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28080  putative transcriptional regulator  32.26 
 
 		 72 aa  41.6  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00426893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0218  transcription regulator, Cro/CI family -related protein  30.16 
 
 		 76 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>