32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3980 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3980  transcriptional regulator  100 
 
 		 76 aa  154  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4458  putative transcriptional regulator, XRE family  89.55 
 
 		 71 aa  124  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0251  transcriptional regulator, XRE family  62.32 
 
 		 72 aa  95.1  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120803  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4807  helix-turn-helix domain-containing protein  60 
 
 		 74 aa  87.8  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125806  hitchhiker  0.00510188 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4286  Cro/CI family transcriptional regulator  54.79 
 
 		 73 aa  87  8e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0373  Cro/CI family transcriptional regulator  60.32 
 
 		 71 aa  86.7  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000000821993  normal  0.249392 
 
 
 
NC_012560  Avin_49660  hypothetical protein  55.56 
 
 		 70 aa  80.5  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000595514  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0975  putative transcriptional regulator, XRE family  49.21 
 
 		 68 aa  72.4  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  46.03 
 
 		 68 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2316  Cro/CI family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 69 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.723017  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2123  hypothetical protein  42.42 
 
 		 69 aa  65.5  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1995  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 71 aa  60.5  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000194045  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1184  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 71 aa  60.1  0.000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0684  XRE family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 89 aa  57  0.00000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0963  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 74 aa  56.2  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000305628 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1800  Cro/CI family transcriptional regulator  40 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0066  transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 		 262 aa  53.5  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0014  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 73 aa  51.2  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127273  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3657  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 79 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.544629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2870  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 69 aa  50.8  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000158683  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0816  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 69 aa  50.8  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1496  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000868778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2649  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 80 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2963  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.364459  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1216  putative HTH-type transcriptional regulator  35.48 
 
 		 75 aa  45.1  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.893532  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0764  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0359167  normal  0.203575 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2160  hypothetical protein  32.26 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.419766  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4838  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0302  transcriptional regulator  28.79 
 
 		 225 aa  43.5  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.41457  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5459  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 92 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0131549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1322  hypothetical protein  28.38 
 
 		 84 aa  40  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117292  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5453  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 80 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.816575  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>