116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1665 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1665  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 74 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.542106  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5039  XRE family transcriptional regulator  95.95 
 
 		 74 aa  144  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.927312 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1757  XRE family transcriptional regulator  95.95 
 
 		 74 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2300  putative transcriptional regulatory protein  91.04 
 
 		 74 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2169  hypothetical protein  91.04 
 
 		 74 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0666173  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2285  Cro/CI family transcription regulator  85.29 
 
 		 74 aa  121  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0100  transcriptional regulator, XRE family  77.94 
 
 		 70 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28080  putative transcriptional regulator  80 
 
 		 72 aa  107  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00426893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1951  XRE family transcriptional regulator  70.42 
 
 		 82 aa  103  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0335085 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4482  XRE family transcriptional regulator  73.53 
 
 		 82 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.111215  normal  0.686525 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4332  helix-turn-helix type 3  71.43 
 
 		 77 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0490  hypothetical protein  70.77 
 
 		 78 aa  99.8  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0466  hypothetical protein  70.77 
 
 		 78 aa  99.8  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1687  helix-turn-helix type 3  73.85 
 
 		 74 aa  99.8  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71330  putative transcriptional regulator  71.21 
 
 		 68 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6190  putative transcriptional regulator  71.21 
 
 		 68 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876157  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0997  transcriptional regulator, XRE family  69.12 
 
 		 69 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3642  XRE family transcriptional regulator  65.28 
 
 		 82 aa  99  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182949  normal  0.278552 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0484  XRE family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 77 aa  98.6  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2718  putative transcriptional regulator  72.31 
 
 		 78 aa  98.6  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.973938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4481  XRE family transcriptional regulator  67.16 
 
 		 69 aa  98.6  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0478  XRE family transcriptional regulator  69.23 
 
 		 70 aa  97.4  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3255  transcriptional regulator, XRE family  67.65 
 
 		 69 aa  96.3  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4792  XRE family transcriptional regulator  69.23 
 
 		 71 aa  95.9  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0662158  normal  0.716445 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2183  XRE family transcriptional regulator  61.76 
 
 		 71 aa  95.1  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3364  transcriptional regulator, XRE family  58.33 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0314  XRE family transcriptional regulator  66.15 
 
 		 74 aa  92  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203005  normal  0.441895 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1037  transcriptional regulator, XRE family  60.81 
 
 		 74 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0375  XRE family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 76 aa  90.9  6e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2209  transcription regulator, Cro/CI family -related protein  57.35 
 
 		 72 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3870  transcriptional regulator, XRE family protein  57.35 
 
 		 69 aa  89.7  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1981  XRE family transcriptional regulator  64.62 
 
 		 68 aa  89.7  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.287792  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2135  XRE family transcriptional regulator  65.08 
 
 		 82 aa  88.2  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.160527 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3882  XRE family transcriptional regulator  71.43 
 
 		 63 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0788  transcriptional regulator, Cro/CI family  51.47 
 
 		 76 aa  88.6  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2194  XRE family transcriptional regulator  57.35 
 
 		 72 aa  88.2  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135264  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1539  transcriptional regulator, XRE family  61.97 
 
 		 71 aa  88.2  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0419417 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5711  transcriptional regulator, XRE family  57.75 
 
 		 75 aa  87.8  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4238  transcriptional regulator, XRE family  57.97 
 
 		 69 aa  87.4  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3550  XRE family transcriptional regulator  58.46 
 
 		 77 aa  86.3  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0218  transcription regulator, Cro/CI family -related protein  57.35 
 
 		 76 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3417  transcriptional regulator, XRE family  60 
 
 		 77 aa  86.7  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2806  transcriptional regulator, XRE family  54.05 
 
 		 81 aa  86.3  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3040  DNA-binding protein  52.86 
 
 		 71 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.119109  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2791  DNA-binding protein  54.41 
 
 		 71 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0381729  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2740  Cro/CI family transcriptional regulator  54.41 
 
 		 71 aa  85.9  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.29378  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2721  Cro/CI family transcriptional regulator  54.41 
 
 		 71 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3003  DNA-binding protein  54.41 
 
 		 71 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0902628  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3598  helix-turn-helix type 3  56.72 
 
 		 77 aa  85.5  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0630  putative transcriptional regulator  55.88 
 
 		 69 aa  85.9  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.054738  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1216  putative HTH-type transcriptional regulator  58.82 
 
 		 75 aa  85.5  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.893532  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3038  DNA-binding protein  54.41 
 
 		 71 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121923  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3005  DNA-binding protein  54.41 
 
 		 71 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2236  DNA-binding protein  54.41 
 
 		 71 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.972034  hitchhiker  0.0000000327322 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3001  DNA-binding protein  54.41 
 
 		 71 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000935469 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2707  transcriptional regulator, XRE family  59.42 
 
 		 78 aa  85.5  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1695  transcriptional regulator  60.61 
 
 		 70 aa  85.1  3e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0597679  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3592  XRE family transcriptional regulator  63.08 
 
 		 68 aa  84.7  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0918  DNA-binding protein  54.17 
 
 		 72 aa  84.7  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1830  transcriptional regulator, XRE family  57.58 
 
 		 74 aa  84.7  4e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05360  transcriptional regulator, Cro/CI family protein  51.47 
 
 		 68 aa  83.6  9e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0033  transcriptional regulator, XRE family  54.79 
 
 		 86 aa  83.2  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.656945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0924  XRE family transcriptional regulator  52.7 
 
 		 77 aa  82.4  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.385099  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3131  transcriptional regulator, XRE family  56.92 
 
 		 67 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2804  XRE family transcriptional regulator  56.92 
 
 		 75 aa  82  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425929  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2988  transcriptional regulator, XRE family  60 
 
 		 74 aa  81.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.962229 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1666  aspartate/glutamate/uridylate kinase-like protein  58.46 
 
 		 67 aa  80.9  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.962131  hitchhiker  0.00000000000435388 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11560  predicted transcriptional regulator  60.29 
 
 		 70 aa  80.5  0.000000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2665  transcriptional regulator, XRE family  52.11 
 
 		 74 aa  79.7  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2733  transcriptional regulator, XRE family  54.41 
 
 		 70 aa  80.1  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3478  transcriptional regulator, XRE family  55.07 
 
 		 76 aa  78.6  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0540861  normal  0.173042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3957  transcriptional regulator, XRE family  54.79 
 
 		 94 aa  77.8  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.010777  normal  0.26793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5760  transcriptional regulator, XRE family  53.62 
 
 		 71 aa  77.4  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205139  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4120  transcriptional regulator, XRE family  53.42 
 
 		 80 aa  77  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.424691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1982  transcriptional regulator, XRE family  55.38 
 
 		 74 aa  76.6  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.995083  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2262  XRE family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 68 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.914675  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1440  XRE family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 78 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3008  XRE family transcriptional regulator  58.46 
 
 		 76 aa  75.1  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0028  XRE family transcriptional regulator  53.03 
 
 		 73 aa  74.3  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230002  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1859  XRE family transcriptional regulator  54.41 
 
 		 75 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000246644  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4237  putative transcriptional regulator, XRE family  52.11 
 
 		 84 aa  73.6  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0543061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8816  transcriptional regulator, XRE family  53.73 
 
 		 79 aa  71.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0809895  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0500  transcriptional regulator, XRE family  52.31 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00719991  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5346  putative transcriptional regulator, XRE family  53.12 
 
 		 79 aa  70.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.413727 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1065  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 74 aa  70.9  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0168  XRE family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 76 aa  69.7  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2650  transcriptional regulator, XRE family  49.21 
 
 		 82 aa  69.7  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.213866  normal  0.098962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4401  transcriptional regulator, XRE family  50.79 
 
 		 76 aa  68.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3116  transcription regulator, Cro/CI family -related protein  57.14 
 
 		 57 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.819469  hitchhiker  0.000000540333 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0937  transcriptional regulator, XRE family  46.97 
 
 		 74 aa  65.1  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.792674  normal  0.0631359 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18370  predicted transcriptional regulator  47.89 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.312817 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0337  transcriptional regulator, XRE family  47.54 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.160189  normal  0.0633386 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2212  putative transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0086  hypothetical protein  43.66 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.417163  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1035  transcriptional regulator, XRE family  47.54 
 
 		 75 aa  57.4  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2888  putative transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139071  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2481  transcriptional regulator, XRE family  48.28 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.400931  normal  0.978354 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2751  transcriptional regulator-like protein  52.27 
 
 		 53 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.080776 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1205  putative transcriptional regulator, XRE family  58.33 
 
 		 54 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.37118  n/a   
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0037  Transcriptional Regulator, XRE family  41.79 
 
 		 90 aa  50.4  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>