43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0373 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0373  Cro/CI family transcriptional regulator  100 
 
 		 71 aa  148  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000000821993  normal  0.249392 
 
 
 
NC_008761  Pnap_4807  helix-turn-helix domain-containing protein  74.65 
 
 		 74 aa  116  9e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125806  hitchhiker  0.00510188 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0251  transcriptional regulator, XRE family  65.22 
 
 		 72 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120803  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2316  Cro/CI family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 69 aa  90.5  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.723017  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4286  Cro/CI family transcriptional regulator  59.09 
 
 		 73 aa  87.8  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4458  putative transcriptional regulator, XRE family  60.32 
 
 		 71 aa  87.4  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3980  transcriptional regulator  60.32 
 
 		 76 aa  86.7  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49660  hypothetical protein  56.25 
 
 		 70 aa  85.5  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000595514  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  50 
 
 		 68 aa  83.6  8e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0975  putative transcriptional regulator, XRE family  55.38 
 
 		 68 aa  82.8  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2123  hypothetical protein  46.88 
 
 		 69 aa  69.3  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0963  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 74 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000305628 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0684  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 89 aa  63.5  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1184  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 71 aa  60.5  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1995  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 71 aa  60.5  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000194045  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3657  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 79 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.544629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1800  Cro/CI family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0014  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 73 aa  55.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127273  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2160  hypothetical protein  35.82 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.419766  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4838  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 71 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5453  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.816575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1496  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 75 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000868778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0066  transcriptional regulator, XRE family  30.16 
 
 		 262 aa  48.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5017  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0305  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00365078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3037  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.548242 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0816  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2870  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000158683  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2963  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 122 aa  47  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.364459  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2262  XRE family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.914675  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5459  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0131549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2649  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 80 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0302  transcriptional regulator  29.69 
 
 		 225 aa  45.1  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.41457  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0764  XRE family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 79 aa  44.7  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0359167  normal  0.203575 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3923  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 58 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.551914  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2358  hypothetical protein  28.77 
 
 		 78 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000081812  decreased coverage  0.0000157362 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28080  putative transcriptional regulator  26.47 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00426893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1665  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.542106  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1757  XRE family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5039  XRE family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.927312 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0630  putative transcriptional regulator  25.76 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.054738  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2183  XRE family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0100  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 70 aa  40  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>