30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_2963 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009674  Bcer98_2963  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 122 aa  248  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.364459  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3459  hypothetical protein  54.55 
 
 		 87 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3539  hypothetical protein  69.05 
 
 		 92 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3823  hypothetical protein  69.05 
 
 		 87 aa  67  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  38.71 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0963  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 74 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000305628 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2316  Cro/CI family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 69 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.723017  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0373  Cro/CI family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 71 aa  47  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000000821993  normal  0.249392 
 
 
 
NC_012560  Avin_49660  hypothetical protein  32.26 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000595514  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0684  XRE family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0975  putative transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3980  transcriptional regulator  32.26 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0014  transcriptional regulator, XRE family  27.4 
 
 		 73 aa  44.7  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127273  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0251  transcriptional regulator, XRE family  29.85 
 
 		 72 aa  44.3  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120803  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2481  transcriptional regulator, XRE family  29.17 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.400931  normal  0.978354 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1800  Cro/CI family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2358  hypothetical protein  34.92 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000081812  decreased coverage  0.0000157362 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4807  helix-turn-helix domain-containing protein  27.42 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125806  hitchhiker  0.00510188 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3657  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.544629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11560  predicted transcriptional regulator  30.3 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1035  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 75 aa  42  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4441  transcriptional regulator, XRE family  35.09 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4458  putative transcriptional regulator, XRE family  25.71 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3550  XRE family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1859  XRE family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 75 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000246644  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0168  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5760  transcriptional regulator, XRE family  27.54 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205139  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0500  transcriptional regulator, XRE family  29.85 
 
 		 75 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00719991  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1037  transcriptional regulator, XRE family  26.98 
 
 		 74 aa  40  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1322  hypothetical protein  30.16 
 
 		 84 aa  40  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117292  normal  0.0168857 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>