125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_1800 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_1800  Cro/CI family transcriptional regulator  100 
 
 
75 aa  154  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1184  transcriptional regulator, XRE family  57.14 
 
 
71 aa  92.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1995  transcriptional regulator, XRE family  57.97 
 
 
71 aa  91.3  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000194045  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3657  transcriptional regulator, XRE family  50.79 
 
 
79 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.544629  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0014  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 
73 aa  73.2  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127273  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2160  hypothetical protein  47.95 
 
 
89 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.419766  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2123  hypothetical protein  44.12 
 
 
69 aa  70.5  0.000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0963  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 
74 aa  63.9  0.0000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000305628 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5017  XRE family transcriptional regulator  40.58 
 
 
77 aa  63.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0251  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 
72 aa  63.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120803  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4286  Cro/CI family transcriptional regulator  39.13 
 
 
73 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0975  putative transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 
68 aa  60.1  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0168  XRE family transcriptional regulator  37.33 
 
 
76 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4458  putative transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 
71 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49660  hypothetical protein  39.34 
 
 
70 aa  58.2  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000595514  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0373  Cro/CI family transcriptional regulator  39.06 
 
 
71 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000000821993  normal  0.249392 
 
 
 
NC_007410  Ava_B0086  hypothetical protein  35.29 
 
 
111 aa  57  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.417163  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  40.98 
 
 
68 aa  56.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3980  transcriptional regulator  40 
 
 
76 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3417  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 
77 aa  55.1  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2791  DNA-binding protein  32.39 
 
 
71 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0381729  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2740  Cro/CI family transcriptional regulator  32.39 
 
 
71 aa  54.7  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.29378  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2721  Cro/CI family transcriptional regulator  32.39 
 
 
71 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3003  DNA-binding protein  32.39 
 
 
71 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0902628  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1216  putative HTH-type transcriptional regulator  37.88 
 
 
75 aa  54.3  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.893532  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3038  DNA-binding protein  32.39 
 
 
71 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121923  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2236  DNA-binding protein  32.39 
 
 
71 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.972034  hitchhiker  0.0000000327322 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3001  DNA-binding protein  32.39 
 
 
71 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000935469 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1982  transcriptional regulator, XRE family  31.08 
 
 
74 aa  54.3  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.995083  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4482  XRE family transcriptional regulator  31.51 
 
 
82 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.111215  normal  0.686525 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2316  Cro/CI family transcriptional regulator  37.7 
 
 
69 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.723017  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0918  DNA-binding protein  35.38 
 
 
72 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0490  hypothetical protein  32.88 
 
 
78 aa  52.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0466  hypothetical protein  32.88 
 
 
78 aa  52.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1951  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 
82 aa  53.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0335085 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0100  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 
70 aa  53.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2733  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 
70 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3005  DNA-binding protein  30.99 
 
 
71 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11560  predicted transcriptional regulator  36.62 
 
 
70 aa  52.4  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3040  DNA-binding protein  31.88 
 
 
71 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.119109  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4332  helix-turn-helix type 3  33.82 
 
 
77 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2804  XRE family transcriptional regulator  33.8 
 
 
75 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425929  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0418  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 
77 aa  52  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000007588  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71330  putative transcriptional regulator  34.92 
 
 
68 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4807  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 
74 aa  51.2  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125806  hitchhiker  0.00510188 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6190  putative transcriptional regulator  34.92 
 
 
68 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876157  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2262  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 
68 aa  51.6  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.914675  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0314  XRE family transcriptional regulator  36.49 
 
 
74 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203005  normal  0.441895 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0997  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 
69 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2988  transcriptional regulator, XRE family  34.25 
 
 
74 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.962229 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2806  transcriptional regulator, XRE family  30.56 
 
 
81 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05360  transcriptional regulator, Cro/CI family protein  38.46 
 
 
68 aa  50.4  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1539  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 
71 aa  50.4  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0419417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5346  putative transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 
79 aa  50.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.413727 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1440  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
78 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3255  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 
69 aa  50.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2650  transcriptional regulator, XRE family  32.86 
 
 
82 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.213866  normal  0.098962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1336  hypothetical protein  31.94 
 
 
86 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.94784  normal  0.842689 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0028  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
73 aa  48.9  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230002  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0684  XRE family transcriptional regulator  26.23 
 
 
89 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3550  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 
77 aa  48.9  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3642  XRE family transcriptional regulator  29.73 
 
 
82 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182949  normal  0.278552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4237  putative transcriptional regulator, XRE family  30.43 
 
 
84 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0543061 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3364  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 
106 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1037  transcriptional regulator, XRE family  28.77 
 
 
74 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5711  transcriptional regulator, XRE family  32.86 
 
 
75 aa  48.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28080  putative transcriptional regulator  31.34 
 
 
72 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00426893  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2194  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 
72 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135264  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3870  transcriptional regulator, XRE family protein  31.88 
 
 
69 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1695  transcriptional regulator  32.79 
 
 
70 aa  48.1  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0597679  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18370  predicted transcriptional regulator  30.88 
 
 
78 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.312817 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4792  XRE family transcriptional regulator  30.99 
 
 
71 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0662158  normal  0.716445 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0630  putative transcriptional regulator  32.31 
 
 
69 aa  48.1  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.054738  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5039  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 
74 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.927312 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2183  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 
71 aa  47.8  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3008  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 
76 aa  47.8  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1665  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 
74 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.542106  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5760  transcriptional regulator, XRE family  32.86 
 
 
71 aa  47.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205139  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0037  Transcriptional Regulator, XRE family  31.58 
 
 
90 aa  47.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110571  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3598  helix-turn-helix type 3  31.82 
 
 
77 aa  47  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0924  XRE family transcriptional regulator  30.88 
 
 
77 aa  47  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.385099  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1757  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 
74 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2209  transcription regulator, Cro/CI family -related protein  28.99 
 
 
72 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4238  transcriptional regulator, XRE family  30.56 
 
 
69 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4120  transcriptional regulator, XRE family  31.88 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.424691  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0937  transcriptional regulator, XRE family  28.79 
 
 
74 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.792674  normal  0.0631359 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2285  Cro/CI family transcription regulator  30.88 
 
 
74 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1687  helix-turn-helix type 3  31.88 
 
 
74 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0484  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
77 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0788  transcriptional regulator, Cro/CI family  29.41 
 
 
76 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4481  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 
69 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2300  putative transcriptional regulatory protein  30.77 
 
 
74 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2358  hypothetical protein  26.67 
 
 
78 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000081812  decreased coverage  0.0000157362 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1666  aspartate/glutamate/uridylate kinase-like protein  27.69 
 
 
67 aa  45.4  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.962131  hitchhiker  0.00000000000435388 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2169  hypothetical protein  30.77 
 
 
74 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0666173  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0478  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 
70 aa  45.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2718  putative transcriptional regulator  34.43 
 
 
78 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.973938  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0218  transcription regulator, Cro/CI family -related protein  29.23 
 
 
76 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8816  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 
79 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0809895  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2888  putative transcriptional regulator, XRE family  30.3 
 
 
93 aa  44.7  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139071  normal  0.202628 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>