29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4838 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4838  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 71 aa  147  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0305  transcriptional regulator, XRE family  86.57 
 
 		 80 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00365078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1496  transcriptional regulator, XRE family  83.58 
 
 		 75 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000868778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3037  transcriptional regulator, XRE family  81.43 
 
 		 80 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.548242 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2649  transcriptional regulator, XRE family  80 
 
 		 80 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5453  transcriptional regulator, XRE family  75.71 
 
 		 80 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.816575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3923  transcriptional regulator, XRE family  91.38 
 
 		 58 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.551914  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5459  transcriptional regulator, XRE family  72 
 
 		 92 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0131549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1995  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 71 aa  56.2  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000194045  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1184  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 71 aa  56.6  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0963  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 74 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000305628 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0764  XRE family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0359167  normal  0.203575 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2316  Cro/CI family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.723017  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4807  helix-turn-helix domain-containing protein  42.65 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125806  hitchhiker  0.00510188 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0251  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 72 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120803  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0373  Cro/CI family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 71 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000000821993  normal  0.249392 
 
 
 
NC_008757  Pnap_4286  Cro/CI family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 73 aa  50.8  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  31.82 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49660  hypothetical protein  33.33 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000595514  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0975  putative transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 68 aa  47.4  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0302  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  46.6  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.41457  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3980  transcriptional regulator  36.51 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1800  Cro/CI family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0037  Transcriptional Regulator, XRE family  34.33 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110571  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4458  putative transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18370  predicted transcriptional regulator  35.38 
 
 		 78 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.312817 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5017  XRE family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0684  XRE family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0484  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 77 aa  40  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>