51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3452 on replicon NC_009468
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009468  Acry_3452  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 119 aa  242  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.663331  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0259  XRE family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 102 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000494587  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2518  transcriptional regulator, XRE family  36.08 
 
 		 101 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000496163  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0503  hypothetical protein  37.35 
 
 		 91 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2215  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 91 aa  67  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.477213  normal  0.498854 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0884  DNA-binding transcriptional regulator  35.71 
 
 		 187 aa  57.4  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.334392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4821  hypothetical protein  31.46 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4853  DNA-binding protein; transcriptional regulator  46.15 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4868  DNA-binding protein; transcriptional regulator  46.15 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5278  DNA-binding protein  46.15 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5023  DNA-binding protein  46.15 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5261  DNA-binding protein  46.15 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5404  DNA-binding protein  46.15 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5291  DNA-binding protein  46.15 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5336  DNA-binding protein  46.15 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4967  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5666  DNA-binding protein  46.15 
 
 		 65 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0730  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 85 aa  47  0.00009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000239544  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2158  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 239 aa  45.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.233392  normal  0.181964 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0424  hypothetical protein  28.57 
 
 		 210 aa  44.7  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0590756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0871  transcriptional regulator, XRE family  35.09 
 
 		 170 aa  44.7  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.56743  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0060  DNA-binding protein  41.18 
 
 		 65 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  32.99 
 
 		 256 aa  44.3  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3714  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 65 aa  44.3  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0543  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0122  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3692  putative transcriptional regulator  32.2 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.376919 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  30.3 
 
 		 255 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0658  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0627  transcriptional regulator, XRE family  45.65 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.845219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2915  XRE family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5481  hypothetical protein  29.11 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.143016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2033  hypothetical protein  40.38 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5380  hypothetical protein  29.11 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0888  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 67 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3942  transcriptional regulator, XRE family  38.78 
 
 		 197 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3489  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 187 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1410  XRE family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0074  hypothetical protein  31.76 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0952  XRE family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0264927 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  34.55 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 300 aa  40.8  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 199 aa  40.4  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  35.59 
 
 		 436 aa  40.4  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 78 aa  40.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1781  DNA-binding protein  34.55 
 
 		 403 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1730  DNA-binding protein  34.55 
 
 		 403 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1558  transcriptional regulator  34.55 
 
 		 403 aa  40  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1606  XRE family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 404 aa  40  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0568777  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1567  transcriptional regulator  34.55 
 
 		 403 aa  40  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1606  DNA-binding protein  34.55 
 
 		 403 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>