32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0317 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0317  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 331 aa  668    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0354  putative simple sugar transport system substrate-binding protein  43.58 
 
 		 357 aa  255  8e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0988695 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5241  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.52 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.635479 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0916  putative simple sugar transport system substrate-binding protein  25.07 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1208  sugar binding protein of ABC transporter  28.3 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0308996  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5835  putative ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  31.82 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4991  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28 
 
 		 385 aa  60.1  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0045  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.3 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.765358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2902  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.35 
 
 		 349 aa  55.8  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3430  ABC transporter binding protein  28.95 
 
 		 316 aa  53.1  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0397056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0550  hypothetical protein  32.94 
 
 		 364 aa  48.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0452037  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3343  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.9 
 
 		 316 aa  48.5  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  unclonable  0.000000000331055  normal  0.275562 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6225  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  30.17 
 
 		 362 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2277  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.29 
 
 		 321 aa  47.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.455143  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0810  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.09 
 
 		 323 aa  47.8  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.869205  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0833  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.09 
 
 		 323 aa  47.8  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4599  putative sugar ABC transporter, substrate-binding protein  30.49 
 
 		 320 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.841849 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5154  putative ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  24.04 
 
 		 342 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0997977  normal  0.778027 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1150  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.43 
 
 		 359 aa  46.6  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1590  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.51 
 
 		 319 aa  45.8  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1425  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.93 
 
 		 316 aa  45.8  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  unclonable  0.00000000184688  normal  0.493371 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1794  monosaccharide-transporting ATPase  25.6 
 
 		 295 aa  45.8  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.37883  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3338  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.87 
 
 		 312 aa  45.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6778  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.93 
 
 		 347 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.158372 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3307  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.11 
 
 		 337 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1890  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25 
 
 		 351 aa  43.9  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1187  sugar ABC transporter (sugar-binding protein)  25.59 
 
 		 337 aa  43.9  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.287912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1643  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.84 
 
 		 338 aa  43.1  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00121645  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1274  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.45 
 
 		 325 aa  42.7  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.031802  normal  0.351389 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1963  sugar ABC transporter substrate-binding protein  29.27 
 
 		 320 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0438  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.06 
 
 		 331 aa  42.7  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.681459  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3072  putative ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  24.13 
 
 		 343 aa  42.7  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00067059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>