46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4991 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4991  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 385 aa  769    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0916  putative periplasmic binding ABC transporter protein  27.36 
 
 		 340 aa  90.1  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5835  putative ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  29.52 
 
 		 324 aa  79  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1150  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.61 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2602  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.52 
 
 		 363 aa  69.7  0.00000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6225  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.39 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1274  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.84 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.031802  normal  0.351389 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0317  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.8 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0916  putative simple sugar transport system substrate-binding protein  27.1 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1425  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.1 
 
 		 316 aa  59.3  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  unclonable  0.00000000184688  normal  0.493371 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0844  hypothetical protein  26.7 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.655414  normal  0.0599894 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1208  sugar binding protein of ABC transporter  24.34 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0308996  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0550  hypothetical protein  24.2 
 
 		 364 aa  55.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0452037  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1017  sugar-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  27.42 
 
 		 319 aa  52.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.353153  normal  0.189775 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0767  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.39 
 
 		 312 aa  51.6  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000173406  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3236  monosaccharide-transporting ATPase  25.69 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.271334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1956  monosaccharide-transporting ATPase  25.32 
 
 		 318 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0141518 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4599  putative sugar ABC transporter, substrate-binding protein  29.17 
 
 		 320 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.841849 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3343  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.57 
 
 		 316 aa  50.8  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  unclonable  0.000000000331055  normal  0.275562 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1668  ABC transporter sugar-binding protein  25 
 
 		 331 aa  50.4  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1963  sugar ABC transporter substrate-binding protein  26.11 
 
 		 320 aa  50.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2690  sugar ABC transporter  24.14 
 
 		 341 aa  49.3  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2454  monosaccharide-transporting ATPase  25.3 
 
 		 319 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1691  sugar ABC transporter  24.46 
 
 		 304 aa  49.3  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0126828  normal  0.746229 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0045  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.49 
 
 		 327 aa  49.3  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.765358  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1342  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.33 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3492  monosaccharide-transporting ATPase  25.32 
 
 		 319 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324039 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5241  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.46 
 
 		 316 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.635479 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0060  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.26 
 
 		 311 aa  48.1  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0393  sugar ABC transporter (sugar-binding protein)  23.08 
 
 		 321 aa  47.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0882  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.35 
 
 		 319 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.577745  normal  0.335079 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0354  putative simple sugar transport system substrate-binding protein  22.22 
 
 		 357 aa  47.8  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0988695 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5154  putative ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  25.9 
 
 		 342 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0997977  normal  0.778027 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1721  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.14 
 
 		 329 aa  47.4  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.525383  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39350  binding protein component precursor of ABC ribose transporter  23.28 
 
 		 319 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.743894 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09440  regulatory protein LacI  21.74 
 
 		 364 aa  47  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00329545  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0947  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.35 
 
 		 319 aa  47  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.103002  normal  0.0230828 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1831  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.65 
 
 		 309 aa  47  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6155  putative sugar (D-ribose) ABC transporter (periplasmic binding protein)  29.51 
 
 		 317 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0424251 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6778  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25 
 
 		 347 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.158372 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3072  putative ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  24.7 
 
 		 343 aa  44.3  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00067059  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0157  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  24.5 
 
 		 329 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000000969227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3430  ABC transporter binding protein  24.47 
 
 		 316 aa  43.9  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0397056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3000  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  21.79 
 
 		 312 aa  43.9  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.434934  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3602  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.07 
 
 		 345 aa  43.5  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.786544  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3338  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.62 
 
 		 312 aa  42.7  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>