39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0560 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0560  protein of unknown function DUF112 transmembrane  100 
 
 		 418 aa  803    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0074  hypothetical protein  34.29 
 
 		 408 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0191721 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1520  protein of unknown function DUF112 transmembrane  31.14 
 
 		 415 aa  176  8e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0515  hypothetical protein  34.15 
 
 		 422 aa  172  6.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2266  hypothetical protein  34.96 
 
 		 389 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.522249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1492  hypothetical protein  32.55 
 
 		 423 aa  171  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2339  protein of unknown function DUF112 transmembrane  30.66 
 
 		 411 aa  170  4e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.145216 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0055  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.61 
 
 		 413 aa  170  4e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0613814  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0540  hypothetical protein  29.88 
 
 		 403 aa  169  8e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222367  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1004  hypothetical protein  32.06 
 
 		 438 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2183  protein of unknown function DUF112 transmembrane  30.32 
 
 		 409 aa  159  9e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.979545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2996  hypothetical protein  29.98 
 
 		 466 aa  155  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2746  protein of unknown function DUF112 transmembrane  30.73 
 
 		 403 aa  144  4e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.901506 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3522  protein of unknown function DUF112 transmembrane  31.16 
 
 		 413 aa  143  7e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.175047  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0040  hypothetical protein  27.75 
 
 		 398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.548535  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0824  hypothetical protein  29.69 
 
 		 400 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.506055  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0783  hypothetical protein  26.54 
 
 		 398 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0576  protein of unknown function DUF112 transmembrane  27.05 
 
 		 440 aa  119  9e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.680015  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0848  hypothetical protein  28.47 
 
 		 398 aa  114  3e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.40812  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0071  hypothetical protein  25.37 
 
 		 505 aa  61.6  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1211  hypothetical protein  24.75 
 
 		 506 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0374344  normal  0.144663 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1753  hypothetical protein  24.39 
 
 		 504 aa  50.1  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0278889  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3268  hypothetical protein  23.96 
 
 		 676 aa  50.1  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000411591 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2223  protein of unknown function DUF112 transmembrane  24.09 
 
 		 502 aa  47.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2439  hypothetical protein  24.37 
 
 		 494 aa  47.4  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1639  tricarboxylic transport  27.72 
 
 		 498 aa  46.2  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1960  protein of unknown function DUF112 transmembrane  23.65 
 
 		 509 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0173399  normal  0.831984 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  24.21 
 
 		 503 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  27.72 
 
 		 504 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  27.72 
 
 		 504 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  27.72 
 
 		 504 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  27.72 
 
 		 504 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  27.72 
 
 		 504 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3966  hypothetical protein  24.18 
 
 		 497 aa  45.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1361  protein of unknown function DUF112 transmembrane  25.94 
 
 		 505 aa  43.5  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0484  hypothetical protein  24.35 
 
 		 505 aa  43.5  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49480  tripartite tricarboxylate transporter large hypothetical protein  24.49 
 
 		 506 aa  43.5  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000126948  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2583  protein of unknown function DUF112 transmembrane  27.11 
 
 		 497 aa  43.5  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2448  hypothetical protein  22.27 
 
 		 498 aa  43.1  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>