19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0540 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0540  hypothetical protein  100 
 
 		 403 aa  772    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222367  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0515  hypothetical protein  60 
 
 		 422 aa  439  9.999999999999999e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2746  protein of unknown function DUF112 transmembrane  55.11 
 
 		 403 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.901506 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0074  hypothetical protein  47.28 
 
 		 408 aa  344  2e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0191721 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2266  hypothetical protein  47.16 
 
 		 389 aa  339  4e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.522249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2996  hypothetical protein  35.06 
 
 		 466 aa  216  7e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1492  hypothetical protein  35.85 
 
 		 423 aa  211  1e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1004  hypothetical protein  32.58 
 
 		 438 aa  194  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2339  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.29 
 
 		 411 aa  179  5.999999999999999e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.145216 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1520  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.41 
 
 		 415 aa  170  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2183  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.18 
 
 		 409 aa  168  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.979545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0055  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.93 
 
 		 413 aa  159  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0613814  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0560  protein of unknown function DUF112 transmembrane  28.6 
 
 		 418 aa  157  4e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3522  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.09 
 
 		 413 aa  152  8e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.175047  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0783  hypothetical protein  24.57 
 
 		 398 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0040  hypothetical protein  23.83 
 
 		 398 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.548535  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0848  hypothetical protein  24.82 
 
 		 398 aa  106  8e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.40812  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0576  protein of unknown function DUF112 transmembrane  26.02 
 
 		 440 aa  101  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.680015  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0824  hypothetical protein  22.52 
 
 		 400 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.506055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>