20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2339 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2339  protein of unknown function DUF112 transmembrane  100 
 
 
411 aa  748    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.145216 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1520  protein of unknown function DUF112 transmembrane  62.19 
 
 
415 aa  425  1e-118  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3522  protein of unknown function DUF112 transmembrane  62.22 
 
 
413 aa  391  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.175047  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2183  protein of unknown function DUF112 transmembrane  59.22 
 
 
409 aa  389  1e-107  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.979545  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0055  protein of unknown function DUF112 transmembrane  57.66 
 
 
413 aa  375  1e-103  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0613814  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1004  hypothetical protein  35.75 
 
 
438 aa  202  6e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2996  hypothetical protein  31.75 
 
 
466 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1492  hypothetical protein  35.28 
 
 
423 aa  189  1e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0540  hypothetical protein  39.54 
 
 
403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222367  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2746  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.94 
 
 
403 aa  167  4e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.901506 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2266  hypothetical protein  33.93 
 
 
389 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.522249  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0560  protein of unknown function DUF112 transmembrane  30.6 
 
 
418 aa  157  3e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0074  hypothetical protein  32.51 
 
 
408 aa  152  8e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0191721 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0515  hypothetical protein  35.7 
 
 
422 aa  143  5e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0783  hypothetical protein  25 
 
 
398 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0040  hypothetical protein  24.75 
 
 
398 aa  132  9e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.548535  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0576  protein of unknown function DUF112 transmembrane  25.77 
 
 
440 aa  106  6e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.680015  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0848  hypothetical protein  25.19 
 
 
398 aa  105  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.40812  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0824  hypothetical protein  25.06 
 
 
400 aa  105  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.506055  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1976  protein of unknown function DUF112 transmembrane  31.62 
 
 
488 aa  44.3  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>