19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2746 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2746  protein of unknown function DUF112 transmembrane  100 
 
 
403 aa  767    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.901506 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0515  hypothetical protein  58.85 
 
 
422 aa  441  1e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0540  hypothetical protein  55.11 
 
 
403 aa  410  1e-113  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222367  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2266  hypothetical protein  49.74 
 
 
389 aa  360  3e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.522249  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0074  hypothetical protein  47.06 
 
 
408 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0191721 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1492  hypothetical protein  35.21 
 
 
423 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2996  hypothetical protein  32.59 
 
 
466 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1004  hypothetical protein  32.43 
 
 
438 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2339  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.95 
 
 
411 aa  166  6.9999999999999995e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.145216 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0055  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.51 
 
 
413 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0613814  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1520  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.24 
 
 
415 aa  164  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3522  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.61 
 
 
413 aa  155  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.175047  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2183  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.7 
 
 
409 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.979545  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0560  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.9 
 
 
418 aa  136  8e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0783  hypothetical protein  28.22 
 
 
398 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0040  hypothetical protein  27.09 
 
 
398 aa  113  5e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.548535  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0848  hypothetical protein  26.33 
 
 
398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.40812  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0576  protein of unknown function DUF112 transmembrane  27.04 
 
 
440 aa  97.4  4e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.680015  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0824  hypothetical protein  25.06 
 
 
400 aa  96.7  6e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.506055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>