20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0576 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0576  protein of unknown function DUF112 transmembrane  100 
 
 		 440 aa  866    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.680015  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1520  protein of unknown function DUF112 transmembrane  25.12 
 
 		 415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0560  protein of unknown function DUF112 transmembrane  26.36 
 
 		 418 aa  105  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2996  hypothetical protein  24.51 
 
 		 466 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0540  hypothetical protein  25.95 
 
 		 403 aa  102  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222367  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1492  hypothetical protein  27.03 
 
 		 423 aa  101  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0515  hypothetical protein  28.18 
 
 		 422 aa  99.4  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1004  hypothetical protein  23.83 
 
 		 438 aa  99.4  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2339  protein of unknown function DUF112 transmembrane  25.48 
 
 		 411 aa  95.9  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.145216 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0074  hypothetical protein  24.76 
 
 		 408 aa  89.7  9e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0191721 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2746  protein of unknown function DUF112 transmembrane  27.04 
 
 		 403 aa  89  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.901506 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2266  hypothetical protein  26.28 
 
 		 389 aa  85.9  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.522249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0040  hypothetical protein  26.15 
 
 		 398 aa  78.2  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.548535  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0055  protein of unknown function DUF112 transmembrane  24.42 
 
 		 413 aa  72  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0613814  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3522  protein of unknown function DUF112 transmembrane  24.6 
 
 		 413 aa  72  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.175047  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0783  hypothetical protein  25.34 
 
 		 398 aa  70.1  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0824  hypothetical protein  24.26 
 
 		 400 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.506055  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0848  hypothetical protein  24.36 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.40812  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2183  protein of unknown function DUF112 transmembrane  24.65 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.979545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4161  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.76 
 
 		 503 aa  44.3  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>