22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0074 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0074  hypothetical protein  100 
 
 
408 aa  786    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0191721 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2746  protein of unknown function DUF112 transmembrane  47.17 
 
 
403 aa  342  1e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.901506 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0540  hypothetical protein  47.28 
 
 
403 aa  338  7e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222367  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0515  hypothetical protein  47.17 
 
 
422 aa  320  1.9999999999999998e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2266  hypothetical protein  43.22 
 
 
389 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.522249  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1492  hypothetical protein  35.77 
 
 
423 aa  203  4e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2996  hypothetical protein  32.44 
 
 
466 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1004  hypothetical protein  35.02 
 
 
438 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0055  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34 
 
 
413 aa  159  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0613814  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0560  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.25 
 
 
418 aa  158  2e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2183  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.17 
 
 
409 aa  152  8.999999999999999e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.979545  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1520  protein of unknown function DUF112 transmembrane  31.01 
 
 
415 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2339  protein of unknown function DUF112 transmembrane  31.36 
 
 
411 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.145216 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0040  hypothetical protein  26.16 
 
 
398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.548535  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0783  hypothetical protein  26.1 
 
 
398 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3522  protein of unknown function DUF112 transmembrane  30.1 
 
 
413 aa  119  7e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.175047  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0848  hypothetical protein  29.04 
 
 
398 aa  107  4e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.40812  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0824  hypothetical protein  25.48 
 
 
400 aa  105  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.506055  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0576  protein of unknown function DUF112 transmembrane  24.76 
 
 
440 aa  89.7  8e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.680015  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1960  protein of unknown function DUF112 transmembrane  24.51 
 
 
509 aa  47.4  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0173399  normal  0.831984 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3966  hypothetical protein  23.13 
 
 
497 aa  44.3  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1455  hypothetical protein  25.58 
 
 
504 aa  42.7  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.265608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>