More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4564 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4564  translation factor SUA5  100 
 
 
336 aa  656    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3936  translation factor SUA5  73.21 
 
 
332 aa  461  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.182526  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3284  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  72.92 
 
 
332 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1544  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  72.13 
 
 
348 aa  454  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676955  normal  0.0127604 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5091  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  67.16 
 
 
333 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0988  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  72.02 
 
 
332 aa  420  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330084 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4625  translation factor SUA5  65.2 
 
 
331 aa  404  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3861  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  65.09 
 
 
327 aa  397  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.647921  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0195  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  58.78 
 
 
389 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0297  translation factor SUA5  60 
 
 
335 aa  318  7e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0755964 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0367  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  59.39 
 
 
346 aa  298  1e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000143554 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0676  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  53.45 
 
 
342 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.727288 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0695  translation factor SUA5  51.33 
 
 
346 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.274507  normal  0.401857 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2651  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.85 
 
 
342 aa  279  6e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654843  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3271  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  51.92 
 
 
346 aa  276  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.917971 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0669  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  51.36 
 
 
341 aa  277  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0303  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.16 
 
 
341 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1003  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein, putative  52.16 
 
 
342 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0840  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.16 
 
 
342 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0044  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.16 
 
 
341 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.939032  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2669  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.5 
 
 
342 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0845  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.16 
 
 
341 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0598  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.16 
 
 
341 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2432  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.16 
 
 
341 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0553  translation factor SUA5  52.82 
 
 
328 aa  275  6e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2011  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  52.25 
 
 
342 aa  275  6e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2622  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.25 
 
 
342 aa  275  6e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378273  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5953  translation factor SUA5  52.19 
 
 
342 aa  275  9e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2542  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.19 
 
 
342 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.636354  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0465  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  50.91 
 
 
347 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.17381 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0507  translation factor SUA5  49.56 
 
 
330 aa  272  5.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160879  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0577  hypothetical protein  52.42 
 
 
336 aa  265  8e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0497  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.08 
 
 
337 aa  263  4e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.271479  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0484  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  51.63 
 
 
337 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.862271 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0452  translation factor SUA5  50.46 
 
 
331 aa  259  3e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3187  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  47.25 
 
 
370 aa  258  9e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.436725  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1674  Sua5/YciO/YrdC family protein  45.99 
 
 
328 aa  249  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1371  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.99 
 
 
328 aa  249  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0607  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  46.75 
 
 
364 aa  249  4e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.97472  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4092  translation factor SUA5  45.76 
 
 
321 aa  235  8e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1811  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.8 
 
 
362 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.101238  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0598  hypothetical protein  40.72 
 
 
329 aa  229  5e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1961  translation factor SUA5  49.1 
 
 
335 aa  226  3e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5174  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  40.35 
 
 
346 aa  220  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5009  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  40.35 
 
 
346 aa  220  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000874149  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5025  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  40.35 
 
 
346 aa  220  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00487742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5568  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  40.35 
 
 
346 aa  220  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00343157  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5503  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  40.35 
 
 
346 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000113963  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5417  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  40.35 
 
 
346 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.7505e-62 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2595  translation factor SUA5  39.59 
 
 
351 aa  220  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0328746  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5452  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  40.12 
 
 
346 aa  219  5e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0228845  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5123  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.24 
 
 
346 aa  219  7e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.401349  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5448  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  39.04 
 
 
346 aa  216  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.011245  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5504  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  38.74 
 
 
346 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000376853  unclonable  1.14998e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3846  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.69 
 
 
347 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00967711  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2023  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  46.59 
 
 
326 aa  212  7.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0150257  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2287  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.77 
 
 
346 aa  205  8e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.036585  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2395  translation factor SUA5  41.67 
 
 
352 aa  205  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3432  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.54 
 
 
349 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0096  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.28 
 
 
354 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1565  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  38.82 
 
 
324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3044  hypothetical protein  36.04 
 
 
322 aa  196  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1247  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  46.18 
 
 
330 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4587  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  46.02 
 
 
329 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0831  translation factor SUA5  43.2 
 
 
327 aa  196  6e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.167827  hitchhiker  0.00199309 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0400  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.9 
 
 
345 aa  196  7e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2902  hypothetical protein  35.74 
 
 
322 aa  195  9e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3166  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.79 
 
 
354 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0126434  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1394  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.67 
 
 
324 aa  193  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.406188 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1267  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  46.04 
 
 
326 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1075  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.47 
 
 
348 aa  192  6e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3319  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.28 
 
 
348 aa  192  7e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.831205  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4473  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  44.69 
 
 
329 aa  191  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17950  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.71 
 
 
364 aa  191  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0108517  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2842  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.62 
 
 
335 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0444  translation factor SUA5  43.88 
 
 
322 aa  191  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193197  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2993  SUA5/YciO/YrdC family translation initiation protein  39.58 
 
 
315 aa  191  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0735  hypothetical protein  35.38 
 
 
325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0774  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.43 
 
 
320 aa  189  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.902931  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4105  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45 
 
 
329 aa  189  7e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854949  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2023  translation factor SUA5  37.83 
 
 
339 aa  187  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.161833  normal  0.111129 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0452  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.2 
 
 
316 aa  187  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.865666 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2418  translation factor SUA5  37.72 
 
 
321 aa  187  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.85919  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0487  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.81 
 
 
318 aa  187  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0445  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.84 
 
 
328 aa  187  3e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4321  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.79 
 
 
356 aa  185  9e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1132  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  44.62 
 
 
329 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0710  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.23 
 
 
331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1857  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.59 
 
 
322 aa  183  4.0000000000000006e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3830  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.71 
 
 
332 aa  182  6e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.905115 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1686  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  37.88 
 
 
315 aa  182  7e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4186  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.89 
 
 
355 aa  182  7e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302621  hitchhiker  0.00000330857 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2151  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.39 
 
 
358 aa  182  8.000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0175  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.22 
 
 
327 aa  182  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.559973  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0715  translation factor SUA5  42.3 
 
 
318 aa  182  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3747  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.76 
 
 
352 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.585251  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4009  hypothetical protein  43.67 
 
 
328 aa  181  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3265  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.81 
 
 
345 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.327071  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1782  translation factor SUA5  34.22 
 
 
337 aa  179  4e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4305  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  41.49 
 
 
327 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0757875 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>