179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3286 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3286  Rubrerythrin  100 
 
 
205 aa  404  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.16737  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3192  Rubrerythrin  98.54 
 
 
205 aa  397  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3092  rubrerythrin  89.76 
 
 
204 aa  326  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.965098  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2736  rubrerythrin  36.87 
 
 
184 aa  96.7  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.542692  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4631  Rubrerythrin  34.83 
 
 
228 aa  95.9  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000498251 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  38.1 
 
 
164 aa  95.1  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  33.9 
 
 
172 aa  90.5  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  32.96 
 
 
165 aa  88.6  6e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  36.11 
 
 
168 aa  88.2  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  32.02 
 
 
165 aa  85.5  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2612  rubrerythrin/rubredoxin protein, putative  38.38 
 
 
168 aa  85.5  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  33.52 
 
 
163 aa  85.5  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  36.87 
 
 
168 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  30.05 
 
 
233 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  34.44 
 
 
168 aa  83.2  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  31.43 
 
 
165 aa  82  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3325  Rubrerythrin  34.66 
 
 
166 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939225  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  35.43 
 
 
166 aa  80.5  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  34.64 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  29.78 
 
 
165 aa  79.3  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  35.56 
 
 
166 aa  79  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3563  rubrerythrin  32.39 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  35 
 
 
166 aa  78.6  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  31.82 
 
 
167 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  32.45 
 
 
178 aa  78.2  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  31.49 
 
 
178 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0921  Rubrerythrin  34.86 
 
 
166 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4255200000000004e-33 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  32.93 
 
 
185 aa  77  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  34.44 
 
 
166 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  32.39 
 
 
164 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  30.9 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  32.58 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1891  rubrerythrin  31.28 
 
 
182 aa  74.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395956  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  33.89 
 
 
165 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  30.29 
 
 
168 aa  74.3  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000346492  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  32.42 
 
 
166 aa  74.3  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  31.49 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  33.52 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  32.57 
 
 
166 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  32.62 
 
 
190 aa  71.6  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08560  rubrerythrin  29.35 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.249013 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  34.25 
 
 
166 aa  71.6  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0082  rubrerythrin  31.14 
 
 
167 aa  71.6  0.000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2089  Rubrerythrin  31.03 
 
 
202 aa  71.2  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1044  rubrerythrin  31.46 
 
 
163 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  29.14 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  34.48 
 
 
166 aa  70.1  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1680  Rubrerythrin  32.98 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0467  rubrerythrin  29.14 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000249666  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19080  Rubrerythrin  29.21 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00100041  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  30.9 
 
 
165 aa  68.9  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  28.65 
 
 
177 aa  68.2  0.00000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0418  Rubrerythrin  26.49 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  28.33 
 
 
178 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  32.04 
 
 
166 aa  67.4  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3532  Rubrerythrin  31.9 
 
 
158 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  30.77 
 
 
216 aa  67.8  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2946  rubrerythrin  30.46 
 
 
202 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0860  rubrerythrin  29.19 
 
 
197 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.069269  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1771  rubrerythrin  27.75 
 
 
184 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0654519  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  32.61 
 
 
166 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  30.39 
 
 
165 aa  67  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0112  hypothetical protein  30.9 
 
 
166 aa  67  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0127739  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12890  rubrerythrin  29.44 
 
 
179 aa  67  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  31.49 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0444  rubrerythrin  28.25 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000156568  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0111  hypothetical protein  31.87 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149828  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2183  rubrerythrin  31.84 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000223416  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  27.07 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  30.94 
 
 
215 aa  65.1  0.0000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1965  rubrerythrin  29.51 
 
 
191 aa  64.7  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00228469  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0739  rubrerythrin  28.98 
 
 
165 aa  64.3  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.491784  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0865  Rubrerythrin  30.34 
 
 
182 aa  64.3  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.41243  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2276  rubrerythrin  31.89 
 
 
190 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.430774 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2346  rubrerythrin  28.96 
 
 
190 aa  63.2  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000333134  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0583  rubrerythrin  31.52 
 
 
166 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0179451  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3337  nigerythrin  29.71 
 
 
202 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2716  Rubrerythrin  30.32 
 
 
190 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2647  rubrerythrin  29.05 
 
 
191 aa  63.5  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000377128  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1286  rubrerythrin  31.38 
 
 
191 aa  63.2  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0599979  hitchhiker  0.000011253 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1797  Rubrerythrin  29.83 
 
 
192 aa  62.8  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0136768  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2379  rubrerythrin  30.05 
 
 
191 aa  62.4  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0439288  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2295  Rubrerythrin  28.12 
 
 
164 aa  62  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460498  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2369  Rubrerythrin  26.11 
 
 
182 aa  62  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  27.22 
 
 
178 aa  62  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0667  rubrerythrin  28.73 
 
 
191 aa  61.6  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.946538 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  27.78 
 
 
221 aa  62  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  29.44 
 
 
183 aa  61.6  0.000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2740  rubrerythrin  28.09 
 
 
173 aa  61.6  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  29.44 
 
 
183 aa  61.6  0.000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  29.44 
 
 
183 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0138  Rubrerythrin  26.29 
 
 
263 aa  60.5  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.996422  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2814  rubrerythrin  29.28 
 
 
190 aa  59.7  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.773613  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0195  rubrerythrin  30.27 
 
 
192 aa  59.3  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.766512 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0670  rubrerythrin  29.67 
 
 
179 aa  59.7  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0740275  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1657  rubrerythrin  26.84 
 
 
194 aa  59.7  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  35.71 
 
 
140 aa  58.9  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0325  rubrerythrin  29.17 
 
 
195 aa  58.9  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.560367  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0301  Rubrerythrin  28.66 
 
 
166 aa  58.5  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0972  rubrerythrin  25.79 
 
 
194 aa  58.2  0.00000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.367114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>