More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2178 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2206  hypothetical protein  98.91 
 
 
457 aa  945    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2178  hypothetical protein  100 
 
 
457 aa  953    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2532  hypothetical protein  71.49 
 
 
455 aa  705    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.877582  normal  0.863101 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0676  L-glutamine synthetase  75.71 
 
 
457 aa  723    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.291312  normal  0.545703 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2101  glutamine synthetase catalytic region  71.93 
 
 
455 aa  696    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00945274  normal  0.235579 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4024  Glutamate--putrescine ligase  50.86 
 
 
471 aa  455  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.283085 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5139  Glutamate--ammonia ligase  47.37 
 
 
457 aa  443  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.551864 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2502  L-glutamine synthetase  46.74 
 
 
452 aa  421  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.979847  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0110  glutamine synthetase, catalytic region  45.93 
 
 
458 aa  406  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4698  L-glutamine synthetase  45.03 
 
 
460 aa  385  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1603  glutamate--ammonia ligase  37.55 
 
 
468 aa  317  2e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0361504 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06870  Glutamine synthetase, putative  37.83 
 
 
482 aa  289  6e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06654  glutamine synthetase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03530)  35.37 
 
 
478 aa  280  5e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0512  glutamate--ammonia ligase  34.9 
 
 
466 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0523  glutamate--ammonia ligase  34.9 
 
 
466 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172344  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0501  glutamate--ammonia ligase  34.9 
 
 
466 aa  256  7e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2130  glutamine synthetase catalytic region  32.37 
 
 
454 aa  254  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.357355 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4065  glutamate--ammonia ligase  34.85 
 
 
469 aa  251  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1610  glutamate--ammonia ligase  34.29 
 
 
459 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1870  L-glutamine synthetase  32.82 
 
 
455 aa  243  7e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156318  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2893  Glutamate--ammonia ligase  33.26 
 
 
455 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.893589  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2783  L-glutamine synthetase  32.31 
 
 
450 aa  237  3e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503835  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1760  Glutamate--ammonia ligase  34.17 
 
 
447 aa  236  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0148642 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0993  glutamate--ammonia ligase  35.16 
 
 
459 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2319  L-glutamine synthetase  35.16 
 
 
459 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2057  glutamate--ammonia ligase  35.49 
 
 
455 aa  236  6e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.454402  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2103  glutamate--ammonia ligase  35.49 
 
 
455 aa  236  6e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183312  normal  0.0293144 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2040  glutamate--ammonia ligase  35.49 
 
 
455 aa  236  9e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.373617 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2633  glutamine synthetase catalytic region  32.59 
 
 
454 aa  234  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0200628  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3881  glutamate--ammonia ligase  32.37 
 
 
456 aa  233  5e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.130901  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2794  glutamate--ammonia ligase  34.37 
 
 
455 aa  233  6e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0169506  normal  0.297978 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2587  L-glutamine synthetase  32.9 
 
 
464 aa  231  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3196  L-glutamine synthetase  33.77 
 
 
455 aa  226  6e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0732  glutamine synthetase family protein  31.33 
 
 
455 aa  225  1e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2278  glutamate--ammonia ligase  33.12 
 
 
459 aa  225  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.206165 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0679  L-glutamine synthetase  29.8 
 
 
453 aa  224  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.08688  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3298  hypothetical protein  32.24 
 
 
459 aa  224  3e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0966227 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0686  glutamine synthetase family protein  30.89 
 
 
455 aa  223  8e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.22551  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12876  glutamine synthetase glnA4  33.18 
 
 
457 aa  219  8.999999999999998e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4670  glutamine synthetase catalytic region  31.47 
 
 
458 aa  217  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1637  Glutamate--putrescine ligase  33.63 
 
 
483 aa  217  4e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0634583  normal  0.087119 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4406  Glutamate--ammonia ligase  32.8 
 
 
461 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7784  glutamine synthetase catalytic region  31.01 
 
 
452 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4547  glutamate--ammonia ligase  31.42 
 
 
453 aa  214  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294027  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1965  glutamine synthetase catalytic region  32.61 
 
 
463 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.771992 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0657  glutamate--putrescine ligase  32.88 
 
 
470 aa  213  5.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.178319  normal  0.618001 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1797  Glutamate--putrescine ligase  31.04 
 
 
455 aa  213  7e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01963  glutamine synthetase family protein  31.86 
 
 
426 aa  207  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00039077  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5310  glutamine synthetase  31.33 
 
 
458 aa  206  7e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4868  glutamate--ammonia ligase  31.12 
 
 
458 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2076  Glutamate--ammonia ligase  34.43 
 
 
454 aa  206  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1181  L-glutamine synthetase  30.8 
 
 
451 aa  204  3e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4416  Glutamate--putrescine ligase  31.17 
 
 
460 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.163105  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1667  glutamine synthetase, catalytic region  29.76 
 
 
474 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0387  glutamine synthetase  30.75 
 
 
458 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5091  glutamate--putrescine ligase  30.69 
 
 
458 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327313  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5184  glutamine synthetase, putative  30.69 
 
 
458 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.92577  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1774  hypothetical protein  31.71 
 
 
447 aa  199  9e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.571871  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5244  glutamate--putrescine ligase  30.47 
 
 
458 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5208  glutamate--putrescine ligase  30.72 
 
 
460 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179896  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0773  glutamate--ammonia ligase  32.13 
 
 
458 aa  198  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03860  putative glutamine synthetase  30.54 
 
 
458 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1851  L-glutamine synthetase  30.99 
 
 
446 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36214  normal  0.378692 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2897  glutamate--putrescine ligase  30.29 
 
 
452 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5347  glutamate--putrescine ligase  30.49 
 
 
460 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.107252 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0341  L-glutamine synthetase  30.26 
 
 
459 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0727612  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0279  glutamate--putrescine ligase  30.26 
 
 
458 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4259  L-glutamine synthetase  31.57 
 
 
447 aa  197  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3148  glutamine synthetase, putative  29.84 
 
 
452 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5299  glutamine synthetase, putative  30.49 
 
 
460 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.802661  normal  0.238566 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3740  glutamate--putrescine ligase  32.03 
 
 
447 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.120298  normal  0.581989 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2707  glutamate--putrescine ligase  29.84 
 
 
452 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210959  normal  0.606055 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2566  glutamate--putrescine ligase  29.84 
 
 
452 aa  196  9e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3247  glutamine synthetase  30.54 
 
 
458 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5408  L-glutamine synthetase  30.04 
 
 
458 aa  196  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532857  hitchhiker  0.00182517 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20670  putative glutamine synthetase  34.58 
 
 
413 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.257217  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4059  L-glutamine synthetase  29.81 
 
 
535 aa  193  5e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.305883  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2393  glutamine synthetase, catalytic region  31.49 
 
 
493 aa  193  7e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0174  glutamate--putrescine ligase  30.49 
 
 
460 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38140  putative glutamine synthetase  29.68 
 
 
458 aa  192  8e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019966 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1921  glutamine synthetase  31.65 
 
 
447 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3011  glutamate--ammonia ligase  29.87 
 
 
451 aa  192  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.858612  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2380  Glutamate--putrescine ligase  29.61 
 
 
456 aa  192  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0068155  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2122  L-glutamine synthetase  30.07 
 
 
458 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0668807  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  34.25 
 
 
456 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03880  glutamine synthetase  30.7 
 
 
452 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1455  glutamate--putrescine ligase  31.48 
 
 
440 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.171449  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0389  glutamine synthetase  30.47 
 
 
452 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00463  glutamine synthetase  31.7 
 
 
461 aa  189  9e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.625789  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  33.87 
 
 
456 aa  189  9e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3850  Glutamate--ammonia ligase  28.51 
 
 
453 aa  189  9e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274285  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3960  glutamate--putrescine ligase  30.43 
 
 
440 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  29.03 
 
 
450 aa  188  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  34.19 
 
 
443 aa  188  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0350  glutamate--ammonia ligase  29.63 
 
 
455 aa  188  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0380504  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  29.87 
 
 
439 aa  187  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  34.1 
 
 
441 aa  187  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2079  L-glutamine synthetase  30.04 
 
 
454 aa  187  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3001  L-glutamine synthetase  28.98 
 
 
451 aa  187  4e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000079724  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4399  glutamine synthetase, putative  34.29 
 
 
413 aa  187  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>