40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1459 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl1459  hypothetical protein  100 
 
 
67 aa  139  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1524  hypothetical protein  88.06 
 
 
67 aa  125  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0146  thiamine biosynthesis protein ThiS  53.03 
 
 
69 aa  72.8  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 
65 aa  53.9  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1747  ThiS  37.31 
 
 
67 aa  53.9  0.0000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0204  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.18 
 
 
72 aa  52.4  0.000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4093  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.06 
 
 
65 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467775  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3429  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.32 
 
 
63 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1933  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 
65 aa  49.7  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1957  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.31 
 
 
63 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27356  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0798  putative ThiS sulfur transfer protein  43.64 
 
 
58 aa  47.8  0.00004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2397  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 
67 aa  47.8  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0239  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  34.33 
 
 
67 aa  47  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.164539 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5919  sulfur carrier protein ThiS  45.28 
 
 
65 aa  46.2  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168418  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0252  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.71 
 
 
70 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2892  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.96 
 
 
65 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502448  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.74 
 
 
65 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433282  normal  0.219669 
 
 
-
 
NC_004310  BR0216  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 
65 aa  46.2  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  31.82 
 
 
65 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6572  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.76 
 
 
69 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922176  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1455  hypothetical protein  36.36 
 
 
75 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.282408  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 
66 aa  44.3  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0207  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 
65 aa  43.9  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.549071  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 
65 aa  43.5  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279126  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 
65 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153528  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1415  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1043  ThiS, thiamine-biosynthesis  24.24 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2563  thiamine biosynthesis protein ThiS  38 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0010  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 
65 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.209764 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  27.27 
 
 
92 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  27.27 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  22.73 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3718  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.827217  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0620  thiamine biosynthesis protein ThiS  27.94 
 
 
67 aa  41.2  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6397  sulfur carrier protein ThiS  37.74 
 
 
65 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0709  sulfur carrier protein ThiS  21.21 
 
 
65 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367637  normal  0.0347852 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2782  putative thiamine biosynthesis protein ThiS  24.24 
 
 
66 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408989  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0444  sulfur carrier protein ThiS  34.33 
 
 
65 aa  40.4  0.007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2442  thiS protein, putative  31.34 
 
 
67 aa  40.4  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  26.87 
 
 
67 aa  40.4  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>