35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3869 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3869  putative periplasmic chaperone protein  100 
 
 		 247 aa  493  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0671  putative periplasmic chaperone protein  100 
 
 		 247 aa  493  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00513818  normal  0.436881 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3781  putative periplasmic chaperone protein  99.57 
 
 		 230 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1632  putative periplasmic chaperone protein  45.28 
 
 		 236 aa  204  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0992283  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0164  putative periplasmic chaperone protein  45.28 
 
 		 232 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0492  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.63 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1754  putative periplasmic chaperone protein  28.71 
 
 		 245 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6325  putative periplasmic chaperone protein  28.71 
 
 		 245 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.997215  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1132  pili assembly chaperone  29.6 
 
 		 237 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4895  putative periplasmic chaperone protein  30.84 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4929  putative periplasmic chaperone protein  30.84 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1678  putative periplasmic chaperone protein  28.1 
 
 		 245 aa  95.9  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4981  putative periplasmic chaperone protein  30.37 
 
 		 235 aa  95.9  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2407  putative periplasmic chaperone protein  28.45 
 
 		 234 aa  91.7  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4477  pili assembly chaperone  29.17 
 
 		 282 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.287547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3183  chaperone protein PapD  25.75 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3197  pili assembly chaperone protein  25.15 
 
 		 247 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3246  pili assembly chaperone protein  25.15 
 
 		 247 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0150608 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3260  pili assembly chaperone protein  25.15 
 
 		 247 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.163968 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3362  pili assembly chaperone protein  25.15 
 
 		 247 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0478294  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1313  pili assembly chaperone  23.04 
 
 		 250 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.654177  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2495  fimbrial chaperone protein  27.38 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0727302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  26.51 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4845  pili assembly chaperone  22.93 
 
 		 227 aa  45.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  24.53 
 
 		 231 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3335  pili assembly chaperone protein  24.53 
 
 		 231 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.63342  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  24.04 
 
 		 231 aa  45.4  0.0009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4918  pili assembly chaperone  22.93 
 
 		 227 aa  45.4  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.458934  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4461  gram-negative pili assembly chaperone protein  23.58 
 
 		 224 aa  45.4  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4952  pili assembly chaperone  22.93 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03010  predicted periplasmic pilin chaperone  24.53 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5004  pili assembly chaperone  22.93 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5007  pili assembly chaperone  22.93 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.42605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02961  hypothetical protein  24.53 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0085  pili assembly chaperone  24.77 
 
 		 234 aa  42.7  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>