29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0623 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0623  hypothetical protein  100 
 
 		 484 aa  998    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0047  hypothetical protein  97.3 
 
 		 358 aa  311  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0309  HNH endonuclease domain-containing protein  93.42 
 
 		 460 aa  311  2e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.201927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2800  hypothetical protein  96.62 
 
 		 358 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.120629  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2725  HNH endonuclease domain-containing protein  96.62 
 
 		 382 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.881817  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1481  HNH endonuclease domain-containing protein  96.62 
 
 		 382 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0438978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4019  hypothetical protein  53.93 
 
 		 416 aa  204  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2982  hypothetical protein  32.94 
 
 		 287 aa  119  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.8595  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3057  hypothetical protein  33.73 
 
 		 280 aa  118  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3653  hypothetical protein  27.38 
 
 		 285 aa  114  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.342414  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3509  hypothetical protein  29.44 
 
 		 286 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1310  hypothetical protein  31.67 
 
 		 306 aa  107  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0405  hypothetical protein  31.67 
 
 		 211 aa  106  9e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00906691  hitchhiker  0.00328119 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0137  hypothetical protein  60.76 
 
 		 77 aa  105  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4108  hypothetical protein  60.76 
 
 		 77 aa  103  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.988398 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1200  hypothetical protein  32.02 
 
 		 293 aa  99  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.10921  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0252  hypothetical protein  27.08 
 
 		 290 aa  98.2  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2516  hypothetical protein  32 
 
 		 338 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0223  hypothetical protein  26.28 
 
 		 304 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00452578  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0225  hypothetical protein  26.09 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3317  hypothetical protein  27.91 
 
 		 275 aa  75.5  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0168552 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3902  hypothetical protein  29.07 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400318  normal  0.0196844 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3264  hypothetical protein  24.21 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443342 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3749  hypothetical protein  64.58 
 
 		 50 aa  67.4  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.141129  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4242  hypothetical protein  35.56 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.272378  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3575  hypothetical protein  75 
 
 		 37 aa  60.1  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.001232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1401  hypothetical protein  27.98 
 
 		 315 aa  56.2  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1094  ImpA domain protein  29.23 
 
 		 411 aa  47.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4243  hypothetical protein  37.14 
 
 		 93 aa  43.9  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.517633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>