186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_2092 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_2092  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 118 aa  238  2e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.681298  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2013  MerR family transcriptional regulator  98.31 
 
 		 120 aa  234  3e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065719  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01390  transcription regulator protein  87.18 
 
 		 118 aa  211  2.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249906  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2798  transcriptional regulator, MerR family  88.03 
 
 		 118 aa  211  3.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1147  MerR family transcriptional regulator  66.95 
 
 		 118 aa  171  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0571667  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0761  MerR family transcriptional regulator  64.96 
 
 		 118 aa  168  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0874748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1983  MerR family transcriptional regulator  65.25 
 
 		 118 aa  166  9e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00884217  normal  0.359201 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1938  MerR family transcriptional regulator  65.25 
 
 		 118 aa  166  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28730  putative transcriptional regulator  65.25 
 
 		 118 aa  165  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000134436  hitchhiker  0.00000000749265 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2511  hypothetical protein  65.25 
 
 		 118 aa  165  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1457  transcriptional regulator, MerR family  71.7 
 
 		 118 aa  163  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1974  MerR family transcriptional regulator  63.56 
 
 		 118 aa  161  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2472  hypothetical protein  64.1 
 
 		 118 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3474  MerR family transcriptional regulator  64.1 
 
 		 118 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283655 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3218  MerR family transcriptional regulator  64.1 
 
 		 118 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.330484 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2054  MerR family transcriptional regulator  62.71 
 
 		 121 aa  159  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1584  MerR family transcriptional regulator  61.02 
 
 		 118 aa  158  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0919  transcriptional regulator, MerR family  63.56 
 
 		 118 aa  157  5e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0434  MerR family transcriptional regulator  66.07 
 
 		 120 aa  157  6e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2169  regulatory protein, MerR  61.86 
 
 		 118 aa  155  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2385  transcriptional regulator, putative  61.86 
 
 		 118 aa  154  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170009  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0494  MerR family transcriptional regulator  62.93 
 
 		 121 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0739492  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2670  regulatory protein, MerR  58.41 
 
 		 125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.988026 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0836  MerR family transcriptional regulator  61.82 
 
 		 116 aa  130  6e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1313  transcriptional regulator, MerR family  75.32 
 
 		 173 aa  130  7.999999999999999e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1551  MerR family transcriptional regulator  58.68 
 
 		 132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.724017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1282  MerR family transcriptional regulator  70.45 
 
 		 143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4609  MerR family transcriptional regulator  73.49 
 
 		 136 aa  128  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.401376  normal  0.0601167 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1996  MerR family transcriptional regulator  72.29 
 
 		 141 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000181748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1719  MerR family transcriptional regulator  71.95 
 
 		 134 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1459  MerR family transcriptional regulator  71.95 
 
 		 137 aa  127  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1640  transcriptional regulator, MerR family  74.36 
 
 		 143 aa  127  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.402978  normal  0.373133 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1000  MerR family transcriptional regulator  71.95 
 
 		 137 aa  127  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.861508  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1482  MerR family transcriptional regulator  71.95 
 
 		 137 aa  127  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.858746  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1970  transcriptional regulator, MerR family  74.36 
 
 		 143 aa  127  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.858434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1772  MerR family transcriptional regulator  71.95 
 
 		 136 aa  127  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.328935  normal  0.318397 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1014  MerR family transcriptional regulator  69.41 
 
 		 121 aa  127  8.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986669 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1406  MerR family transcriptional regulator  71.95 
 
 		 137 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1089  MerR family transcriptional regulator  71.95 
 
 		 134 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1898  MerR family regulatory protein  71.95 
 
 		 134 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1532  MerR family transcriptional regulator  71.95 
 
 		 134 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.591284  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3096  MerR family transcriptional regulator  74.36 
 
 		 140 aa  126  9.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0714876 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0196  MerR family transcriptional regulator  71.95 
 
 		 134 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.196176  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1742  MerR family transcriptional regulator  71.95 
 
 		 134 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3018  transcriptional regulator, MerR family  56.9 
 
 		 126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.438934  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1584  putative transcription regulator protein  73.42 
 
 		 146 aa  125  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2588  MerR family transcriptional regulator  71.95 
 
 		 134 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1378  MerR family transcriptional regulator  71.95 
 
 		 137 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0815083  normal  0.541754 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1167  MerR family transcriptional regulator  69.32 
 
 		 144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354578  normal  0.670626 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1366  MerR family transcriptional regulator  71.95 
 
 		 137 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0970  MerR family transcriptional regulator  71.95 
 
 		 126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2236  transcriptional regulator, MerR family  62.38 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.039823 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2607  transcriptional regulator, MerR family  62.38 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1881  putative transcriptional regulator  69.41 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.027165 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4622  MerR family transcriptional regulator  73.42 
 
 		 137 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206932  normal  0.899334 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2852  MerR family transcriptional regulator  73.08 
 
 		 130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.164617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2393  MerR family transcriptional regulator  73.08 
 
 		 142 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.161279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1455  transcriptional regulator, MerR family  73.08 
 
 		 142 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2109  MerR family transcriptional regulator  68.75 
 
 		 159 aa  124  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.208629  normal  0.127157 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2749  transcriptional regulator, MerR family  73.42 
 
 		 137 aa  124  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1343  MerR family transcriptional regulator  69.23 
 
 		 149 aa  123  9e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1408  transcriptional regulator, MerR family  50.86 
 
 		 126 aa  123  9e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00332069  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1471  transcriptional regulator domain-containing protein  50.86 
 
 		 126 aa  123  9e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.22835  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1752  MerR family transcriptional regulator  70.24 
 
 		 161 aa  123  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0206721 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1877  transcriptional regulator, MerR family  66.67 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2847  MerR family transcriptional regulator  69.23 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.786709  hitchhiker  0.005225 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1660  MerR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3741  transcriptional regulator, MerR family  50.93 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274926  normal  0.767741 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1889  transcriptional regulator, MerR family  55.26 
 
 		 116 aa  93.6  9e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000504717  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3922  MerR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 144 aa  90.5  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.856583  normal  0.167239 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1997  transcriptional regulator, MerR family  47.52 
 
 		 112 aa  89  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2223  transcriptional regulator, MerR family  47.52 
 
 		 112 aa  89  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000299442 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1425  transcriptional regulator  42.99 
 
 		 116 aa  87  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000104332  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1418  MerR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 116 aa  84.3  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000205103  normal  0.491097 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1288  transcriptional regulator, MerR family  45.45 
 
 		 179 aa  84  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0650  transcriptional regulator, MerR family  47.06 
 
 		 172 aa  83.6  8e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00809015 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1199  transcriptional regulator, MerR family  45.45 
 
 		 179 aa  83.6  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3558  MerR family transcriptional regulator  57.81 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.994671 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1521  MerR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0401274  normal  0.779885 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0267  MerR family transcriptional regulator  53.95 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1633  hypothetical protein  49.33 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2678  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00961924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1501  MerR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.259398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1588  MerR family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3038  MerR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0025515  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4387  MerR family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 757 aa  78.6  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1409  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.783915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2621  MerR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 117 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361193  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0831  MerR family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 177 aa  77.4  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.087298  normal  0.0939438 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2516  MerR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 179 aa  77.4  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1522  transcriptional regulator, putative  42.06 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0919543  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1669  MerR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 241 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1416  MerR family transcriptional regulator  52.05 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0849625  normal  0.242004 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6232  MerR family transcriptional regulator  52 
 
 		 166 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4629  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 187 aa  77.4  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00782953  normal  0.030329 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2364  MerR family transcriptional regulator  45.56 
 
 		 151 aa  77  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1148  MerR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 169 aa  77  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3022  transcriptional regulator, MerR family  48.68 
 
 		 250 aa  77  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7073  transcriptional regulator, MerR family  53.33 
 
 		 172 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.323694  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0772  hypothetical protein  44.32 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>