27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0965 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0979  replication initiation factor  100 
 
 
391 aa  792    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0965  replication initiation factor  100 
 
 
391 aa  792    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000376009  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0517  replication initiation factor  99.49 
 
 
391 aa  788    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.341925  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1102  hypothetical protein  96.59 
 
 
391 aa  750    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000501354  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1084  hypothetical protein  95.66 
 
 
382 aa  714    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000848597  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0994  replication initiation factor  99.49 
 
 
391 aa  788    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.047597  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00564  phage replication protein  35.16 
 
 
304 aa  162  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0887  putative phage replication initiation protein  29.18 
 
 
477 aa  95.1  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0553548  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0367  putative phage replication initiation factor  29.18 
 
 
477 aa  95.1  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0594202  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4466  replication initiation factor  28.22 
 
 
380 aa  94  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.979448  hitchhiker  0.000360835 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1389  replication initiation factor  31.98 
 
 
365 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0245511  normal  0.60169 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0724  replication initiation factor  29.74 
 
 
364 aa  74.3  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.960925  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2407  replication initiation factor  29.82 
 
 
420 aa  74.7  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.29742  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2103  replication initiation factor  26.14 
 
 
368 aa  67  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.608188  normal  0.0902845 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2390  replication initiation factor  31.2 
 
 
341 aa  67  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.667451 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2973  phage replication protein  36.21 
 
 
371 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0488089  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1066  RstA1 protein  27.48 
 
 
359 aa  61.2  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1069  RstA1 protein  27.48 
 
 
359 aa  61.2  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.317105  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0506  RstA1 protein  27.48 
 
 
359 aa  61.2  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.307749  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1705  replication initiation factor family protein  24.3 
 
 
398 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1988  hypothetical protein  27.14 
 
 
342 aa  52.8  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008500  STER_A3  transcriptional regulator  23.28 
 
 
368 aa  51.6  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0631  phage replication and integration protein  32.53 
 
 
415 aa  51.2  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0634  phage replication protein  32.53 
 
 
415 aa  51.2  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000148  RstA phage-related replication protein  25 
 
 
382 aa  48.9  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02310  hypothetical protein  24.28 
 
 
381 aa  47  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05778  hypothetical protein  31.33 
 
 
381 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>